ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lolium multiflorum plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019651	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743719
2	NC_019651	AGA	4	3274	3284	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_019651	TAA	4	3565	3576	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_019651	TCT	4	4522	4533	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_019651	GAA	4	8314	8325	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_019651	TTG	4	10614	10624	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42743720
7	NC_019651	TAT	4	14593	14603	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_019651	TAT	4	16830	16840	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_019651	AAC	4	22483	22494	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42743720
10	NC_019651	ATT	4	29268	29280	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_019651	GTT	6	30950	30967	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	42743721
12	NC_019651	TGC	4	31680	31691	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743721
13	NC_019651	AAG	4	41829	41840	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743721
14	NC_019651	AGT	4	42233	42243	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42743721
15	NC_019651	ATT	4	46711	46721	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_019651	TAA	4	47406	47416	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_019651	GAA	4	57874	57884	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_019651	AAG	4	58147	58157	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_019651	TTC	4	60073	60084	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42743723
20	NC_019651	TTC	5	64640	64654	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
21	NC_019651	AGA	4	73721	73732	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743724
22	NC_019651	TAT	4	74785	74795	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743724
23	NC_019651	ATT	4	75374	75384	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743724
24	NC_019651	CTT	5	79753	79766	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	42743724
25	NC_019651	TTC	4	80871	80881	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42743724
26	NC_019651	TAC	4	89267	89278	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42743724
27	NC_019651	ATA	4	104774	104784	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42743727
28	NC_019651	CAA	4	107932	107942	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	42743727
29	NC_019651	TTA	4	111873	111884	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42743727
30	NC_019651	GTA	4	125746	125757	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	42743727

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lolium multiflorum plastid