ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Festuca pratensis plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019650	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743705
2	NC_019650	AGA	4	3272	3282	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_019650	TAA	4	3563	3574	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_019650	TCT	4	4521	4532	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
5	NC_019650	GAA	4	8316	8327	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_019650	TTG	4	10616	10626	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42743705
7	NC_019650	TAT	4	14601	14611	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_019650	TAT	4	16870	16880	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_019650	AAC	4	22542	22553	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42743706
10	NC_019650	ATT	4	29348	29360	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_019650	GTT	6	31030	31047	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	42743706
12	NC_019650	TGC	4	31752	31763	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743706
13	NC_019650	AAG	4	41900	41911	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743707
14	NC_019650	AGT	4	42304	42314	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42743707
15	NC_019650	ATT	4	46787	46797	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_019650	TAA	4	47482	47492	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_019650	GAA	4	57934	57944	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_019650	AAG	4	58207	58217	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_019650	TTC	4	60133	60144	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42743708
20	NC_019650	TTC	5	64694	64708	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
21	NC_019650	AGA	4	73804	73815	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743709
22	NC_019650	TAT	4	74868	74878	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743709
23	NC_019650	ATT	4	75458	75468	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743709
24	NC_019650	CTT	5	79840	79853	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	42743709
25	NC_019650	TTC	4	80959	80969	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42743709
26	NC_019650	TAC	4	89355	89366	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42743709
27	NC_019650	ATA	4	104872	104882	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42743713
28	NC_019650	CAA	4	108036	108046	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	42743713
29	NC_019650	GTA	4	125860	125871	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	42743713

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Festuca pratensis plastid