ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Festuca pratensis plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019650	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743705
2	NC_019650	AAGT	3	786	796	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42743705
3	NC_019650	ATAG	3	1212	1222	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_019650	TCTTT	3	2621	2635	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	42743705
5	NC_019650	AGA	4	3272	3282	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_019650	ATTT	3	3450	3460	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_019650	TAA	4	3563	3574	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_019650	TCT	4	4521	4532	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_019650	TCTCT	3	4720	4733	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	42743705
10	NC_019650	CATAT	3	5838	5852	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
11	NC_019650	TTTAA	3	6009	6022	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_019650	AAGAA	3	6064	6078	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_019650	TTAA	3	6388	6399	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_019650	TTCT	3	6988	6998	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42743705
15	NC_019650	ATTTT	3	7571	7585	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_019650	GAA	4	8316	8327	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_019650	AAAT	3	8605	8615	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_019650	GAAA	3	10211	10222	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743705
19	NC_019650	TTG	4	10616	10626	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42743705
20	NC_019650	AG	6	11336	11346	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_019650	AGCGT	3	12247	12260	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
22	NC_019650	ATTT	3	13002	13012	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_019650	C	13	14090	14102	13	0 %	0 %	0 %	100 %	7 %	Non-Coding
24	NC_019650	AAGA	3	14151	14162	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_019650	CT	6	14265	14275	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
26	NC_019650	TAGG	3	14553	14564	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_019650	TAT	4	14601	14611	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_019650	CTTT	3	15022	15032	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_019650	A	14	15118	15131	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_019650	ATAC	4	16262	16276	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
31	NC_019650	AAAT	3	16599	16609	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_019650	TAT	4	16870	16880	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_019650	ATCA	3	17137	17147	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_019650	ATGA	3	17523	17534	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_019650	A	14	18186	18199	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_019650	A	13	20658	20670	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	42743706
37	NC_019650	AAC	4	22542	22553	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42743706
38	NC_019650	AGAA	3	24440	24451	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743706
39	NC_019650	TTCA	3	27043	27053	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42743706
40	NC_019650	ATT	4	29348	29360	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_019650	A	17	29430	29446	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_019650	AGAA	3	30253	30263	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_019650	AT	6	30295	30305	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_019650	GTT	6	31030	31047	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	42743706
45	NC_019650	TA	6	31509	31519	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_019650	TGC	4	31752	31763	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743706
47	NC_019650	TAAA	3	31987	31997	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_019650	CTTT	3	32019	32029	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
49	NC_019650	GAAA	3	33141	33152	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743706
50	NC_019650	CAAA	3	36440	36451	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_019650	AAGA	3	38933	38944	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743707
52	NC_019650	GACT	3	38972	38983	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	42743707
53	NC_019650	AATG	3	39332	39343	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	42743707
54	NC_019650	TG	6	39774	39784	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	42743707
55	NC_019650	AAG	4	41900	41911	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743707
56	NC_019650	ATCA	3	41943	41953	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42743707
57	NC_019650	AGT	4	42304	42314	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42743707
58	NC_019650	CTTT	3	42323	42334	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42743707
59	NC_019650	TTCA	3	43621	43632	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
60	NC_019650	ACAA	4	43648	43663	16	75 %	0 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
61	NC_019650	TA	6	45334	45344	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_019650	A	12	45422	45433	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019650	AAAG	3	45456	45466	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_019650	AT	6	45905	45915	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_019650	TATT	3	45987	45998	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_019650	TTGA	3	46395	46407	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_019650	ATT	4	46787	46797	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_019650	TAA	4	47482	47492	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_019650	CAGA	3	48178	48188	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	42743707
70	NC_019650	T	14	49290	49303	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42743707
71	NC_019650	A	12	50506	50517	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_019650	AATT	3	53595	53606	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_019650	TGCA	3	55160	55172	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	42743708
74	NC_019650	AATA	3	55949	55960	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_019650	TA	6	56561	56571	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_019650	TAGA	3	56615	56626	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_019650	TTGAA	3	57906	57920	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_019650	GAA	4	57934	57944	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_019650	TTTTA	3	58054	58068	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_019650	AAG	4	58207	58217	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_019650	T	12	58716	58727	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42743708
82	NC_019650	ATTC	3	59152	59162	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
83	NC_019650	TTC	4	60133	60144	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42743708
84	NC_019650	TTCA	3	63652	63663	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
85	NC_019650	GAAA	3	64479	64489	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_019650	TTTA	3	64634	64644	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_019650	TTC	5	64694	64708	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
88	NC_019650	GAAA	3	64956	64967	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743709
89	NC_019650	TAAA	3	65212	65223	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_019650	TA	7	65769	65781	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_019650	ATGT	3	67071	67081	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	42743709
92	NC_019650	AGAA	3	67933	67944	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	42743709
93	NC_019650	ATTTTT	3	67964	67981	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	42743709
94	NC_019650	AAGA	3	68080	68091	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743709
95	NC_019650	ACTT	3	70251	70261	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42743709
96	NC_019650	A	14	71322	71335	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	42743709
97	NC_019650	GAAA	3	71387	71398	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743709
98	NC_019650	TA	6	72306	72316	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42743709
99	NC_019650	CCAT	3	72635	72647	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	42743709
100	NC_019650	TTTC	3	73771	73782	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42743709
101	NC_019650	AGA	4	73804	73815	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743709
102	NC_019650	TAT	4	74868	74878	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743709
103	NC_019650	ATT	4	75458	75468	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743709
104	NC_019650	T	12	76051	76062	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42743709
105	NC_019650	T	12	76069	76080	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42743709
106	NC_019650	TTTTC	4	76625	76644	20	0 %	80 %	0 %	20 %	5 %	42743709
107	NC_019650	AAAG	3	77133	77144	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743709
108	NC_019650	A	18	78456	78473	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	42743709
109	NC_019650	TTTTC	3	78570	78584	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	42743709
110	NC_019650	TTAT	3	78612	78622	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42743709
111	NC_019650	TTAT	3	79259	79270	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42743709
112	NC_019650	ATTT	4	79443	79458	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	42743709
113	NC_019650	CTT	5	79840	79853	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	42743709
114	NC_019650	T	17	80266	80282	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	42743709
115	NC_019650	TTC	4	80959	80969	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42743709
116	NC_019650	A	12	83246	83257	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	42743709
117	NC_019650	TA	7	84198	84211	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42743709
118	NC_019650	TCAAAA	4	85250	85273	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	42743709
119	NC_019650	ATTCTT	3	87979	87997	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	42743709
120	NC_019650	TTTGTT	3	88463	88481	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	42743709
121	NC_019650	TTCT	3	88602	88612	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42743709
122	NC_019650	TAC	4	89355	89366	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42743709
123	NC_019650	TAGTAT	3	90276	90294	19	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	10 %	42743713
124	NC_019650	ATCC	3	93526	93537	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	42743713
125	NC_019650	ACGG	3	96640	96651	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	42743713
126	NC_019650	AGGT	3	96924	96935	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	42743713
127	NC_019650	AACG	3	98249	98260	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	42743713
128	NC_019650	AAAG	4	99552	99567	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	42743713
129	NC_019650	GAAT	3	101167	101177	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42743713
130	NC_019650	AATG	3	103798	103808	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42743713
131	NC_019650	TTAA	3	103812	103823	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42743713
132	NC_019650	TA	6	104196	104207	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42743713
133	NC_019650	CAAA	3	104638	104649	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	42743713
134	NC_019650	ATTA	3	104722	104733	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	42743713
135	NC_019650	ATA	4	104872	104882	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42743713
136	NC_019650	CAA	4	108036	108046	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	42743713
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138	NC_019650	TAAT	3	111593	111605	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42743713
139	NC_019650	AAAG	3	111743	111753	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42743713
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149	NC_019650	GGAT	3	121689	121700	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	42743713
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157	NC_019650	TGAA	3	132122	132133	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
158	NC_019650	AAAAAG	3	134944	134961	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Festuca pratensis plastid