ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Festuca ovina plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019649	CAG	4	680	691	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42640661
2	NC_019649	AAGT	3	786	796	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42640661
3	NC_019649	ATAG	3	1212	1222	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_019649	TTAA	4	1681	1695	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	42640662
5	NC_019649	TCTTT	3	2594	2608	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	42640662
6	NC_019649	AAT	4	3537	3549	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_019649	AAAAAG	3	3563	3579	17	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
8	NC_019649	TCTCT	3	4665	4678	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	42640662
9	NC_019649	TTAT	3	5816	5826	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_019649	TTTAA	3	5924	5937	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_019649	TTAA	3	6324	6335	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_019649	TTCT	3	6924	6934	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42640662
13	NC_019649	AAAT	3	7299	7310	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_019649	ATTT	3	7503	7514	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_019649	T	15	7763	7777	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_019649	GAA	4	8237	8248	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_019649	TTTC	3	8315	8327	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
18	NC_019649	CAAAT	3	8462	8476	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
19	NC_019649	GAAA	3	10124	10135	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640662
20	NC_019649	TTG	4	10529	10539	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42640662
21	NC_019649	AG	6	11249	11259	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_019649	AGCGT	3	12154	12167	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
23	NC_019649	TAT	4	13803	13813	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_019649	CTTT	3	14211	14221	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
25	NC_019649	A	15	14323	14337	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_019649	GTAT	3	15107	15117	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_019649	ATAC	4	15418	15433	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
28	NC_019649	AAAT	3	15759	15769	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_019649	TAT	4	16030	16040	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_019649	ATCA	3	16297	16307	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_019649	ATGA	3	16687	16698	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_019649	TATGG	3	17038	17052	15	20 %	40 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019649	TAT	5	18043	18058	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_019649	AGA	4	19047	19058	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42640662
35	NC_019649	A	13	19819	19831	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	42640662
36	NC_019649	AAC	4	21703	21714	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42640663
37	NC_019649	AGAA	3	23601	23612	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640663
38	NC_019649	AT	6	24672	24683	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640663
39	NC_019649	TTCA	3	26204	26214	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42640663
40	NC_019649	GTTT	3	26521	26531	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	42640663
41	NC_019649	GAA	4	26729	26740	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42640663
42	NC_019649	TTAA	3	28451	28462	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_019649	CAAT	3	28476	28487	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_019649	ATT	4	28521	28533	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_019649	A	17	28608	28624	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_019649	AGAA	3	29431	29441	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_019649	AT	6	29473	29483	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_019649	GTT	5	30204	30218	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	42640663
49	NC_019649	T	12	30369	30380	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019649	TTGC	3	30421	30432	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
51	NC_019649	AG	6	30478	30488	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_019649	TAT	4	30682	30694	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_019649	TGC	4	30928	30939	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42640663
54	NC_019649	TAAA	3	31163	31173	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_019649	GAAA	3	32080	32091	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640663
56	NC_019649	AAAG	3	32249	32260	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640663
57	NC_019649	CAAA	3	35412	35423	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
58	NC_019649	AAGA	3	37905	37916	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640663
59	NC_019649	GACT	3	37944	37955	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	42640663
60	NC_019649	AATG	3	38304	38315	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	42640663
61	NC_019649	TG	6	38746	38756	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	42640663
62	NC_019649	CTAG	3	38848	38860	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	42640663
63	NC_019649	ATTT	3	40279	40289	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_019649	AGAA	4	41043	41057	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	42640664
65	NC_019649	AGT	4	41253	41263	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42640664
66	NC_019649	CTTT	3	41272	41283	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42640664
67	NC_019649	TCCT	3	41302	41313	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	42640664
68	NC_019649	A	15	42389	42403	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	42640664
69	NC_019649	TTCA	3	42570	42581	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_019649	AAAC	3	42595	42606	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019649	TA	6	44270	44280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_019649	AAAG	3	44391	44401	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_019649	TATT	3	44909	44920	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_019649	A	12	45220	45231	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019649	TTGA	3	45319	45331	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_019649	TTA	5	46100	46114	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_019649	ATCTT	4	46571	46589	19	20 %	60 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
78	NC_019649	CAGA	3	47046	47056	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	42640664
79	NC_019649	T	14	48154	48167	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42640664
80	NC_019649	TGCAT	3	48716	48730	15	20 %	40 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019649	AAAAG	3	48995	49009	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_019649	TTTC	3	52384	52395	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
83	NC_019649	AATT	3	52459	52470	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_019649	TGCA	3	54020	54032	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	42640664
85	NC_019649	AATA	3	54791	54802	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_019649	TA	6	55157	55167	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_019649	TTGAA	3	56452	56466	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_019649	GAA	4	56480	56490	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_019649	AAG	4	56735	56745	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_019649	ATTC	3	57665	57675	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
91	NC_019649	TTC	4	58650	58661	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42640665
92	NC_019649	CTTT	3	58973	58984	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
93	NC_019649	TTC	4	58998	59012	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
94	NC_019649	TTGT	3	61313	61324	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_019649	A	13	61388	61400	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019649	TTCA	3	61996	62007	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019649	TTTA	3	62916	62926	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
98	NC_019649	TTC	5	62971	62985	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
99	NC_019649	GAAA	3	63233	63244	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640665
100	NC_019649	TAAA	3	63455	63466	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_019649	TA	7	64059	64071	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_019649	ATGT	3	65360	65370	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	42640666
103	NC_019649	TTTCTA	3	65432	65450	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	42640666
104	NC_019649	AGAA	3	66226	66237	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	42640666
105	NC_019649	ACTT	3	68540	68550	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42640666
106	NC_019649	TTTC	3	69365	69375	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42640666
107	NC_019649	GAAA	3	69648	69659	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640666
108	NC_019649	TTTC	3	72092	72103	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42640666
109	NC_019649	AGA	4	72124	72135	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42640666
110	NC_019649	TAT	4	73188	73198	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640666
111	NC_019649	ATT	4	73776	73786	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640666
112	NC_019649	CTTT	3	73822	73833	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42640666
113	NC_019649	AGAA	3	74069	74079	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42640666
114	NC_019649	T	12	74391	74402	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42640666
115	NC_019649	T	12	74409	74420	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42640666
116	NC_019649	A	13	76856	76868	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	42640666
117	NC_019649	TTTTC	3	76965	76979	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	42640666
118	NC_019649	TTAT	3	77007	77017	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42640666
119	NC_019649	TTAT	3	77654	77665	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42640666
120	NC_019649	ATTT	3	77838	77849	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42640666
121	NC_019649	CTT	5	78235	78248	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	42640666
122	NC_019649	TTC	4	79351	79361	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42640666
123	NC_019649	ATC	4	80952	80964	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	42640666
124	NC_019649	TA	6	82581	82592	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640666
125	NC_019649	TCAAAA	4	83629	83652	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	42640666
126	NC_019649	ATTCTT	3	86333	86351	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	42640666
127	NC_019649	CCTA	3	86489	86500	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	42640666
128	NC_019649	TTTGTT	3	86817	86835	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	42640666
129	NC_019649	TTCT	3	86956	86966	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42640666
130	NC_019649	TAC	4	87709	87720	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42640666
131	NC_019649	GTATTA	4	88676	88700	25	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	42640669
132	NC_019649	ATTC	3	89278	89289	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42640669
133	NC_019649	AAAC	3	91591	91603	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	42640669
134	NC_019649	ATCC	3	91725	91736	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	42640669
135	NC_019649	ACGG	3	94838	94849	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	42640669
136	NC_019649	AGGT	3	95122	95133	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	42640669
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163	NC_019649	TAGG	3	124995	125006	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
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167	NC_019649	AAAG	3	132823	132834	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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