ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Festuca altissima plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019648	CAG	4	681	692	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743695
2	NC_019648	AAT	4	3568	3580	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_019648	GAA	4	8245	8256	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_019648	TTG	4	10538	10548	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42743696
5	NC_019648	TAT	4	14522	14532	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_019648	TAT	4	15299	15310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_019648	TAT	4	16938	16948	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_019648	AAC	4	22591	22602	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42743696
9	NC_019648	GAA	4	27617	27628	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743696
10	NC_019648	ATT	4	29397	29409	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_019648	GAA	4	30223	30234	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743696
12	NC_019648	GTT	6	31072	31089	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	42743696
13	NC_019648	TGC	4	31795	31806	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743697
14	NC_019648	AAG	4	41955	41966	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743697
15	NC_019648	AGT	4	42358	42368	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42743697
16	NC_019648	TAA	4	47502	47512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_019648	GAA	4	57903	57913	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_019648	AAG	4	58166	58176	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_019648	TTC	4	60091	60102	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42743698
20	NC_019648	TTC	5	64636	64650	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
21	NC_019648	AGA	4	73687	73698	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743699
22	NC_019648	TAT	4	74751	74761	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743699
23	NC_019648	ATT	4	75351	75361	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743699
24	NC_019648	TAT	5	78027	78041	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42743699
25	NC_019648	CTT	5	79733	79746	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	42743699
26	NC_019648	TTC	4	80848	80858	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42743699
27	NC_019648	TAC	4	89234	89245	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42743699
28	NC_019648	ATA	4	104797	104807	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42743703
29	NC_019648	CAA	4	107981	107991	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	42743703
30	NC_019648	GTA	4	125856	125867	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	42743703

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Festuca altissima plastid