ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Festuca altissima plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019648	CAG	4	681	692	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743695
2	NC_019648	AAGT	3	787	797	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42743695
3	NC_019648	ATAG	3	1213	1223	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_019648	TCTTT	3	2624	2638	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	42743695
5	NC_019648	ATTT	3	3458	3468	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_019648	AAT	4	3568	3580	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_019648	AAAAG	3	3595	3609	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_019648	ATTT	3	4512	4523	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_019648	TCTCT	3	4697	4710	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	42743695
10	NC_019648	CATAT	3	5800	5814	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
11	NC_019648	TTTAA	3	5971	5984	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_019648	TTAA	3	6333	6344	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_019648	TTCT	3	6933	6943	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42743695
14	NC_019648	ATTTT	3	7508	7521	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_019648	TTCT	3	7826	7836	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_019648	A	17	7976	7992	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
17	NC_019648	GAA	4	8245	8256	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_019648	CAAAT	3	8471	8485	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
19	NC_019648	AAAT	3	8527	8537	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_019648	GAAA	3	10133	10144	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743696
21	NC_019648	TTG	4	10538	10548	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42743696
22	NC_019648	AG	6	11258	11268	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_019648	AGCGT	3	12166	12179	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
24	NC_019648	AAGA	3	14070	14081	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_019648	CT	6	14184	14194	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
26	NC_019648	TAGG	3	14472	14483	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_019648	TAT	4	14522	14532	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_019648	CTTT	3	14917	14927	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
29	NC_019648	TAT	4	15299	15310	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_019648	GTAT	3	15833	15843	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_019648	ATAC	4	16329	16344	16	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
32	NC_019648	AAAT	3	16667	16677	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_019648	TAT	4	16938	16948	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_019648	ATCA	3	17205	17215	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
35	NC_019648	ATGA	3	17581	17592	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_019648	A	13	20707	20719	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	42743696
37	NC_019648	AAC	4	22591	22602	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	42743696
38	NC_019648	AGAA	3	24489	24500	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743696
39	NC_019648	TTCA	3	27092	27102	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42743696
40	NC_019648	GAA	4	27617	27628	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743696
41	NC_019648	ATT	4	29397	29409	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_019648	A	17	29476	29492	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_019648	GAA	4	30223	30234	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743696
44	NC_019648	AGAA	3	30299	30309	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_019648	AT	6	30341	30351	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_019648	GTT	6	31072	31089	18	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	42743696
47	NC_019648	TA	6	31552	31562	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_019648	TGC	4	31795	31806	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42743697
49	NC_019648	TAAA	3	32030	32040	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_019648	CTTT	3	32062	32072	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
51	NC_019648	GAAA	3	33172	33183	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743697
52	NC_019648	AAAG	3	33341	33352	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743697
53	NC_019648	AAAT	3	35749	35760	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_019648	CAAA	3	36498	36509	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
55	NC_019648	AAGA	3	38991	39002	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743697
56	NC_019648	GACT	3	39030	39041	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	42743697
57	NC_019648	AATG	3	39390	39401	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	42743697
58	NC_019648	TG	6	39832	39842	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	42743697
59	NC_019648	CTTT	3	41457	41467	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_019648	AAG	4	41955	41966	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743697
61	NC_019648	ATCA	3	41998	42008	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42743697
62	NC_019648	AGT	4	42358	42368	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42743697
63	NC_019648	CTTT	3	42377	42388	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42743697
64	NC_019648	TCCT	3	42407	42418	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	42743697
65	NC_019648	TTCA	3	43675	43686	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
66	NC_019648	GGGGAA	3	44519	44537	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_019648	T	17	45341	45357	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_019648	AT	7	45356	45368	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_019648	A	14	45452	45465	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_019648	AAAG	3	45488	45498	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_019648	AT	6	45932	45944	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_019648	TATT	3	46017	46028	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_019648	TTGA	3	46424	46436	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_019648	TAA	4	47502	47512	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_019648	CAGA	3	48179	48189	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	42743697
76	NC_019648	T	14	49291	49304	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42743697
77	NC_019648	A	13	50503	50515	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_019648	TTTC	3	53516	53527	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
79	NC_019648	AATT	3	53591	53602	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_019648	GATA	3	54050	54060	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_019648	TGCA	3	55151	55163	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	42743698
82	NC_019648	A	12	55831	55842	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_019648	AATA	3	55939	55950	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_019648	ATAAA	3	56226	56239	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
85	NC_019648	TA	6	56545	56555	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_019648	TTGAA	3	57875	57889	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
87	NC_019648	GAA	4	57903	57913	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_019648	AAG	4	58166	58176	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_019648	ATTC	3	59111	59121	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
90	NC_019648	TTC	4	60091	60102	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42743698
91	NC_019648	A	12	60695	60706	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_019648	A	17	62981	62997	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
93	NC_019648	TTCA	3	63594	63605	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019648	AAAGA	3	64362	64375	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_019648	GAAA	3	64427	64437	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_019648	TTTA	3	64583	64593	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_019648	TTC	5	64636	64650	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
98	NC_019648	GAAA	3	64898	64909	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743699
99	NC_019648	TAAA	3	65119	65130	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_019648	TA	7	65676	65688	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_019648	ATGT	3	66974	66984	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	42743699
102	NC_019648	AGAA	3	67842	67853	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	42743699
103	NC_019648	AAGA	3	67983	67994	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743699
104	NC_019648	ACTT	3	70156	70166	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42743699
105	NC_019648	GAAA	3	71271	71282	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743699
106	NC_019648	AT	7	72187	72199	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42743699
107	NC_019648	TTTC	3	73654	73665	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42743699
108	NC_019648	AGA	4	73687	73698	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42743699
109	NC_019648	TAT	4	74751	74761	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743699
110	NC_019648	CTTTA	5	75321	75344	24	20 %	60 %	0 %	20 %	8 %	42743699
111	NC_019648	ATT	4	75351	75361	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42743699
112	NC_019648	AGAA	3	75643	75653	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42743699
113	NC_019648	T	12	75965	75976	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42743699
114	NC_019648	T	12	75983	75994	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42743699
115	NC_019648	AAAG	3	77043	77054	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42743699
116	NC_019648	TAT	5	78027	78041	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42743699
117	NC_019648	TTAT	3	78505	78515	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42743699
118	NC_019648	TTAT	3	79152	79163	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42743699
119	NC_019648	ATTT	3	79336	79347	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42743699
120	NC_019648	CTT	5	79733	79746	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	42743699
121	NC_019648	TTC	4	80848	80858	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42743699
122	NC_019648	TA	6	84083	84094	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42743699
123	NC_019648	TCAAAA	4	85132	85155	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	42743699
124	NC_019648	ATTCTT	3	87858	87876	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	42743699
125	NC_019648	TTTGTT	3	88342	88360	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	42743699
126	NC_019648	TTCT	3	88481	88491	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42743699
127	NC_019648	TAC	4	89234	89245	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42743699
128	NC_019648	TAGTAT	4	90155	90179	25	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	42743703
129	NC_019648	AAAC	3	93277	93289	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	42743703
130	NC_019648	ATCC	3	93411	93422	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	42743703
131	NC_019648	ACGG	3	96524	96535	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	42743703
132	NC_019648	AGGT	3	96808	96819	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	42743703
133	NC_019648	AACG	3	98133	98144	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	42743703
134	NC_019648	AAAG	4	99442	99457	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	42743703
135	NC_019648	GAAT	3	101053	101063	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42743703
136	NC_019648	AAGG	3	101065	101076	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	42743703
137	NC_019648	AGAT	3	101262	101273	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	42743703
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166	NC_019648	AAAG	3	134932	134943	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Festuca altissima plastid