ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Calliphora vicina mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019639	ATT	4	1018	1029	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640649
2	NC_019639	AGG	4	2084	2095	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	42640649
3	NC_019639	ATT	4	3676	3686	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640649
4	NC_019639	ATT	4	3928	3939	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640649
5	NC_019639	TTTAT	3	4938	4951	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42640649
6	NC_019639	TATTTT	3	5825	5842	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	42640649
7	NC_019639	CTTT	3	6131	6141	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_019639	AAT	4	6518	6530	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640650
9	NC_019639	TAAA	3	6610	6621	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640650
10	NC_019639	ACT	4	6703	6714	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	42640650
11	NC_019639	TAT	4	7044	7055	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640650
12	NC_019639	ATA	6	7301	7317	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	42640650
13	NC_019639	TGAA	3	7389	7399	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42640650
14	NC_019639	AAG	4	7445	7456	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42640650
15	NC_019639	AAAT	3	7540	7550	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640650
16	NC_019639	ATCC	3	7700	7712	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	42640650
17	NC_019639	TAA	4	7739	7751	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640650
18	NC_019639	ATA	4	8309	8320	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640650
19	NC_019639	TCTAAT	3	8703	8720	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	42640650
20	NC_019639	AAAT	3	9027	9037	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640650
21	NC_019639	AAAAT	3	9116	9129	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42640650
22	NC_019639	TAA	4	9156	9167	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640650
23	NC_019639	TAA	4	9189	9200	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640650
24	NC_019639	TAA	4	9369	9380	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640650
25	NC_019639	TAAA	4	9602	9617	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	42640650
26	NC_019639	TTTTAT	3	9922	9939	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	42640650
27	NC_019639	ATTTT	4	10033	10052	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	42640650
28	NC_019639	TAAT	3	10341	10353	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42640650
29	NC_019639	ATT	4	10765	10775	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640650
30	NC_019639	TAA	4	11114	11125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640650
31	NC_019639	TTAA	3	11512	11522	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640650
32	NC_019639	ATTAA	4	11630	11648	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	42640650
33	NC_019639	AAAAG	3	11804	11817	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	42640650
34	NC_019639	TAAA	3	12090	12101	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640650
35	NC_019639	TAA	4	12527	12539	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640650
36	NC_019639	AAT	4	12546	12558	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640650
37	NC_019639	TATAT	3	12649	12662	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_019639	TAAA	3	13110	13120	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_019639	TA	6	13364	13374	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_019639	TAA	4	13438	13450	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_019639	ATTT	6	13506	13529	24	25 %	75 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
42	NC_019639	ACT	4	14443	14454	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
43	NC_019639	ATTT	3	14458	14469	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_019639	AAAT	3	14542	14553	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_019639	TTA	4	14738	14750	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_019639	TTTAAC	3	14855	14873	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
47	NC_019639	ATTTAA	3	14972	14990	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_019639	AT	6	15060	15072	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_019639	ATTT	3	15132	15143	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
50	NC_019639	A	14	15158	15171	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_019639	ATA	8	15228	15252	25	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_019639	TAA	4	15285	15296	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_019639	ATTT	3	15379	15390	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_019639	A	13	15405	15417	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_019639	TTAAA	4	15418	15438	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_019639	ATA	4	15483	15494	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_019639	TAA	4	15499	15511	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_019639	AATA	3	15515	15526	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_019639	ATTT	3	15577	15588	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_019639	AAAAT	5	15607	15632	26	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_019639	TTA	4	15657	15668	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_019639	TAAT	3	15679	15691	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_019639	T	26	15897	15922	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_019639	TTAA	3	15958	15969	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_019639	T	20	16040	16059	20	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_019639	A	25	16072	16096	25	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Calliphora vicina mitochondrion