ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lucilia porphyrina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019637	AATT	3	581	592	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640646
2	NC_019637	TA	6	775	785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640646
3	NC_019637	TTAT	3	805	815	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42640646
4	NC_019637	ATT	4	1021	1032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640646
5	NC_019637	AGG	4	2085	2096	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	42640646
6	NC_019637	AGGA	3	2202	2213	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	42640646
7	NC_019637	TAA	4	3701	3711	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640646
8	NC_019637	AT	6	4803	4813	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640647
9	NC_019637	ATT	4	4815	4826	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640647
10	NC_019637	TTTAT	3	4944	4957	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42640647
11	NC_019637	TTAA	3	5475	5486	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	42640647
12	NC_019637	TA	6	5489	5499	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_019637	TTAA	3	5785	5795	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640647
14	NC_019637	ATTTTA	3	5833	5850	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	42640647
15	NC_019637	CTTT	3	6131	6141	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_019637	ATT	4	6390	6400	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640647
17	NC_019637	AAT	4	6518	6530	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640647
18	NC_019637	AAAT	3	6615	6626	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640647
19	NC_019637	ACT	4	6703	6714	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42640647
20	NC_019637	AAAG	3	6908	6919	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42640647
21	NC_019637	AAG	4	7025	7036	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42640647
22	NC_019637	ATA	6	7301	7317	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	42640647
23	NC_019637	AAG	4	7445	7456	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42640647
24	NC_019637	TAT	4	7506	7516	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640647
25	NC_019637	TAAA	3	7669	7680	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640647
26	NC_019637	TAA	4	7739	7751	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640647
27	NC_019637	GTAAAA	3	8180	8197	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	42640647
28	NC_019637	TCTAAT	3	8703	8720	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	42640647
29	NC_019637	AAAT	3	9027	9037	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640647
30	NC_019637	AAAAT	3	9116	9129	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42640647
31	NC_019637	TAA	5	9171	9184	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640647
32	NC_019637	TAAA	5	9602	9620	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	42640647
33	NC_019637	TTTTAT	3	9922	9939	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	42640647
34	NC_019637	ATTTT	4	10033	10052	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	42640647
35	NC_019637	TTTA	3	10078	10089	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42640647
36	NC_019637	TAA	4	11114	11125	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640647
37	NC_019637	TTA	4	11134	11145	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640647
38	NC_019637	TTAA	3	11512	11522	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640647
39	NC_019637	AAATC	3	11887	11901	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	42640647
40	NC_019637	TAAA	3	12089	12100	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640647
41	NC_019637	AAAG	3	12264	12274	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42640647
42	NC_019637	TAA	4	12526	12538	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640647
43	NC_019637	AAT	4	12545	12557	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640647
44	NC_019637	AAT	4	13037	13048	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_019637	TAAA	3	13107	13117	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_019637	TAA	4	13437	13449	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_019637	TTAA	5	13582	13602	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_019637	ATT	4	13871	13882	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_019637	ACT	4	14445	14456	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
50	NC_019637	AAAT	3	14544	14555	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_019637	ATT	4	14739	14751	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_019637	AAAT	3	14753	14764	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019637	AAAAAT	3	14835	14853	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_019637	AAAT	3	15029	15040	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019637	TAAA	4	15077	15092	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_019637	ATA	4	15116	15127	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_019637	T	23	15296	15318	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_019637	TAAT	4	15439	15454	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_019637	AT	19	15682	15718	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_019637	ATA	6	15794	15810	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_019637	A	21	15835	15855	21	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lucilia porphyrina mitochondrion