ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Protophormia terraenovae mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019636	GGA	4	2075	2085	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	42640645
2	NC_019636	AGGA	3	2191	2202	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	42640645
3	NC_019636	ATT	5	3227	3240	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640645
4	NC_019636	AAAC	3	3553	3565	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	42640645
5	NC_019636	ATT	4	3921	3933	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640645
6	NC_019636	CTTT	3	6117	6127	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
7	NC_019636	ATT	4	6376	6386	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640645
8	NC_019636	ACT	4	6689	6699	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	42640645
9	NC_019636	AAG	4	7431	7441	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	42640645
10	NC_019636	AAAT	3	7526	7536	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640645
11	NC_019636	ATCC	3	7686	7698	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	42640645
12	NC_019636	TAA	4	7725	7737	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640645
13	NC_019636	AAAT	3	8139	8150	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640645
14	NC_019636	GTAAAA	3	8166	8183	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	42640645
15	NC_019636	ATA	4	8295	8306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640645
16	NC_019636	TCTAAT	3	8689	8706	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	42640645
17	NC_019636	AAAT	3	9013	9023	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640645
18	NC_019636	AAAAT	3	9102	9115	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42640645
19	NC_019636	TCT	4	9124	9135	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42640645
20	NC_019636	TAA	4	9175	9186	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640645
21	NC_019636	TAA	4	9355	9366	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640645
22	NC_019636	GTAT	3	9389	9399	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	42640645
23	NC_019636	TAAA	5	9588	9606	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	42640646
24	NC_019636	TTTTAT	3	9908	9925	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	42640646
25	NC_019636	TTTA	3	10064	10075	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42640646
26	NC_019636	TTTA	4	10124	10139	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	42640646
27	NC_019636	ATT	4	10504	10515	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640646
28	NC_019636	AGT	4	11377	11388	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	42640646
29	NC_019636	ATTAA	4	11616	11634	19	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	42640646
30	NC_019636	AAAG	3	11788	11798	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42640646
31	NC_019636	AAATC	3	11874	11888	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	42640646
32	NC_019636	TAAA	3	12076	12087	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640646
33	NC_019636	TAA	4	12513	12525	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640646
34	NC_019636	AAT	4	12532	12544	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640646
35	NC_019636	TAAA	3	13095	13105	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_019636	ATTT	3	13371	13382	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019636	ATTT	6	13491	13514	24	25 %	75 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
38	NC_019636	TTAA	5	13568	13588	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_019636	ATT	4	13857	13868	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_019636	ACT	4	14429	14440	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
41	NC_019636	AAAT	3	14528	14539	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_019636	TAAT	3	14857	14868	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_019636	TAA	4	14987	14999	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_019636	TA	12	15030	15051	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_019636	ATA	7	15104	15125	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_019636	T	14	15157	15170	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Protophormia terraenovae mitochondrion