ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chrysomya rufifacies mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019634	TAA	4	762	772	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640642
2	NC_019634	ATT	4	1004	1015	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640642
3	NC_019634	ATT	4	1340	1350	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_019634	TAT	4	1992	2003	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640642
5	NC_019634	TAAA	3	2622	2632	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640642
6	NC_019634	ATTCA	3	2864	2878	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	42640642
7	NC_019634	ATT	5	3230	3243	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640642
8	NC_019634	ATT	4	4594	4605	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640642
9	NC_019634	TTTAT	3	4940	4953	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42640642
10	NC_019634	TTTA	3	5174	5184	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42640642
11	NC_019634	ATT	4	5840	5850	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640642
12	NC_019634	CTTT	3	6131	6141	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_019634	CAAA	3	6356	6366	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	42640643
14	NC_019634	ATT	4	6388	6398	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640643
15	NC_019634	TAAC	3	6489	6499	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42640643
16	NC_019634	AAT	4	6516	6528	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640643
17	NC_019634	AAG	4	7026	7038	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	42640643
18	NC_019634	TTA	4	7194	7205	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640643
19	NC_019634	ATA	5	7299	7313	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42640643
20	NC_019634	AAAT	3	7538	7548	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640643
21	NC_019634	AAAT	3	8037	8048	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640643
22	NC_019634	GTAAAA	3	8178	8195	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	42640643
23	NC_019634	TCTAAT	3	8701	8718	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	42640643
24	NC_019634	AAAT	3	9025	9035	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640643
25	NC_019634	AAAAT	3	9114	9127	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42640643
26	NC_019634	TCT	4	9136	9147	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42640643
27	NC_019634	TAA	5	9169	9182	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640643
28	NC_019634	TAA	4	9367	9378	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640643
29	NC_019634	GTAT	3	9401	9411	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	42640643
30	NC_019634	TAAA	4	9600	9615	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	42640643
31	NC_019634	ATT	4	9739	9750	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640643
32	NC_019634	TTTA	3	10082	10093	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	42640643
33	NC_019634	ATT	4	10526	10537	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640643
34	NC_019634	ATT	4	10773	10783	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640643
35	NC_019634	TAT	4	11115	11125	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640643
36	NC_019634	TTAA	3	11520	11530	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640643
37	NC_019634	TTAA	3	12652	12664	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_019634	TTAA	3	12969	12979	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_019634	TTA	4	13016	13028	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_019634	TAAA	3	13118	13128	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_019634	ATTT	3	13395	13406	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019634	TAA	4	13447	13459	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_019634	ATTT	6	13515	13538	24	25 %	75 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
44	NC_019634	ATT	4	13881	13892	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_019634	AAAT	3	13962	13973	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_019634	ACT	4	14453	14464	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_019634	AAATAA	3	14840	14858	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
48	NC_019634	AT	7	15062	15075	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_019634	TA	14	15081	15107	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_019634	TA	11	15184	15204	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_019634	ATA	4	15283	15294	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_019634	TAAA	3	15300	15310	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chrysomya rufifacies mitochondrion