ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chrysomya megacephala mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019633	TTA	4	1021	1032	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640640
2	NC_019633	TAT	5	1999	2013	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	42640641
3	NC_019633	AGG	4	2090	2101	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	42640641
4	NC_019633	ATT	5	3243	3256	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640641
5	NC_019633	TAACAT	3	4314	4331	18	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	42640641
6	NC_019633	TTA	4	4583	4595	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640641
7	NC_019633	TTA	4	4607	4618	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640641
8	NC_019633	ATTTTA	3	5840	5857	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	42640641
9	NC_019633	TTA	4	5853	5863	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640641
10	NC_019633	CTTT	3	6145	6155	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_019633	ATTA	3	6258	6269	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_019633	ATT	4	6404	6414	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640641
13	NC_019633	ACAA	3	6672	6684	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	42640641
14	NC_019633	ACT	4	6717	6728	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	42640641
15	NC_019633	AAG	4	7039	7050	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42640641
16	NC_019633	ATA	6	7315	7331	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	42640641
17	NC_019633	TAA	4	7753	7765	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640641
18	NC_019633	GTAAAA	3	8194	8211	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	42640641
19	NC_019633	ATA	4	8323	8334	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640641
20	NC_019633	TCTAAT	3	8717	8734	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	42640641
21	NC_019633	TAAT	3	8949	8960	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640641
22	NC_019633	AAAT	3	9041	9051	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640641
23	NC_019633	AAAAT	3	9130	9143	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42640641
24	NC_019633	TAA	4	9383	9394	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640641
25	NC_019633	TAAA	5	9616	9634	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	42640641
26	NC_019633	TTTTAT	4	9930	9953	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	42640641
27	NC_019633	TTTA	3	10092	10103	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42640641
28	NC_019633	ATT	4	10149	10161	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640641
29	NC_019633	ATT	4	10532	10543	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640642
30	NC_019633	AGT	4	11405	11416	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	42640642
31	NC_019633	TAAA	3	12103	12114	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640642
32	NC_019633	AAAG	3	12278	12288	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42640642
33	NC_019633	TAA	4	12540	12552	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640642
34	NC_019633	TAAA	3	13123	13133	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_019633	ATTT	3	13400	13411	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019633	TAA	4	13452	13464	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_019633	TTAA	5	13597	13617	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_019633	ATT	4	13886	13897	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_019633	ACT	4	14458	14469	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
40	NC_019633	AAT	4	14741	14752	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_019633	ATA	5	14859	14873	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_019633	ATAA	4	14890	14904	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
43	NC_019633	AT	12	15114	15136	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_019633	TAAAA	4	15145	15165	21	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_019633	T	26	15237	15262	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chrysomya megacephala mitochondrion