ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pellia endiviifolia chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019628	ATA	4	1632	1643	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
2	NC_019628	CAT	4	4162	4172	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	42869766
3	NC_019628	AAT	4	14488	14498	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
4	NC_019628	ATA	7	17346	17366	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
5	NC_019628	AGA	4	17793	17804	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42869766
6	NC_019628	GTT	4	18130	18141	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42869766
7	NC_019628	CAG	4	18233	18244	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
8	NC_019628	AGT	4	23468	23478	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42869766
9	NC_019628	AGA	4	28802	28812	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	42869766
10	NC_019628	TGC	4	29824	29835	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
11	NC_019628	AAG	4	30093	30104	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42869766
12	NC_019628	AAT	4	35149	35160	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
13	NC_019628	TGC	4	41857	41868	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
14	NC_019628	ATT	4	42198	42209	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
15	NC_019628	CCA	4	46268	46278	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	42869766
16	NC_019628	AAT	4	48358	48368	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
17	NC_019628	TTG	4	49885	49895	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42869766
18	NC_019628	ATT	4	51129	51140	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
19	NC_019628	TAT	4	51331	51343	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42869766
20	NC_019628	ATT	4	53827	53838	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
21	NC_019628	TAA	4	54225	54236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
22	NC_019628	TAA	4	56922	56932	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
23	NC_019628	AGC	4	57472	57483	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
24	NC_019628	TAT	4	58767	58778	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
25	NC_019628	TAA	4	58782	58792	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
26	NC_019628	ATT	4	60556	60568	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42869766
27	NC_019628	TAT	4	64957	64967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42869766
28	NC_019628	ATA	4	65147	65158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
29	NC_019628	TTA	4	68043	68054	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
30	NC_019628	TAA	4	69668	69678	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869771
31	NC_019628	ATA	4	74976	74986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_019628	ACG	4	80565	80576	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869772
33	NC_019628	TTC	4	85235	85245	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
34	NC_019628	CTT	4	85706	85718	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_019628	ACT	4	86865	86876	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019628	TAA	7	94336	94356	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_019628	ATT	4	97160	97170	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42869773
38	NC_019628	TTC	4	97716	97726	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42869773
39	NC_019628	ATA	4	105195	105205	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869774
40	NC_019628	ATA	4	108363	108374	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869774
41	NC_019628	AGT	4	116178	116189	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019628	GAA	4	117335	117347	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pellia endiviifolia chloroplast