ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Pellia endiviifolia chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019628	ATA	4	1632	1643	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
2	NC_019628	TA	6	1708	1718	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
3	NC_019628	AAAT	3	3713	3724	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42869766
4	NC_019628	TA	7	4018	4030	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42869766
5	NC_019628	CAT	4	4162	4172	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	42869766
6	NC_019628	ATTTT	3	4174	4187	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42869766
7	NC_019628	AAAT	3	4480	4491	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42869766
8	NC_019628	AGAT	3	4555	4565	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42869766
9	NC_019628	A	12	4894	4905	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	42869766
10	NC_019628	AT	6	5148	5158	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
11	NC_019628	TTGA	3	5717	5728	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	42869766
12	NC_019628	TA	10	5744	5763	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	42869766
13	NC_019628	TA	6	5948	5958	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
14	NC_019628	A	13	6520	6532	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	42869766
15	NC_019628	AATAA	3	9478	9491	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42869766
16	NC_019628	ATCT	3	11691	11701	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42869766
17	NC_019628	AT	6	13030	13043	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42869766
18	NC_019628	AAT	4	14488	14498	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
19	NC_019628	CTTT	3	14995	15006	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42869766
20	NC_019628	ATA	7	17346	17366	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
21	NC_019628	AAAT	3	17422	17433	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42869766
22	NC_019628	ATTT	4	17488	17503	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	42869766
23	NC_019628	AGA	4	17793	17804	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42869766
24	NC_019628	GTT	4	18130	18141	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42869766
25	NC_019628	CAG	4	18233	18244	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
26	NC_019628	AATTT	3	19143	19156	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	42869766
27	NC_019628	TTAT	3	22500	22510	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42869766
28	NC_019628	AT	7	22587	22600	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42869766
29	NC_019628	TA	18	22817	22849	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
30	NC_019628	TA	11	23141	23161	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
31	NC_019628	TCAG	3	23231	23242	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	42869766
32	NC_019628	AGT	4	23468	23478	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	42869766
33	NC_019628	TC	6	23752	23763	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	42869766
34	NC_019628	GGAT	3	26204	26214	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	42869766
35	NC_019628	A	13	28308	28320	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	42869766
36	NC_019628	AGA	4	28802	28812	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	42869766
37	NC_019628	AAAT	3	29144	29155	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42869766
38	NC_019628	TGC	4	29824	29835	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
39	NC_019628	AAG	4	30093	30104	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42869766
40	NC_019628	CTTG	3	30194	30204	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	42869766
41	NC_019628	TA	6	30647	30657	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
42	NC_019628	ATGGT	3	30771	30785	15	20 %	40 %	40 %	0 %	0 %	42869766
43	NC_019628	ATAA	3	32393	32404	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42869766
44	NC_019628	CAAAA	3	33280	33294	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	42869766
45	NC_019628	ATTTT	3	33586	33600	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	42869766
46	NC_019628	TAGG	3	33647	33657	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	42869766
47	NC_019628	AAT	4	35149	35160	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
48	NC_019628	AATT	3	35735	35746	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42869766
49	NC_019628	AATA	3	38401	38412	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42869766
50	NC_019628	TTAA	3	38663	38674	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42869766
51	NC_019628	T	14	38773	38786	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42869766
52	NC_019628	AATA	3	38933	38945	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	42869766
53	NC_019628	ATTT	3	38959	38969	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42869766
54	NC_019628	TA	6	41062	41072	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
55	NC_019628	TGC	4	41857	41868	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
56	NC_019628	ATT	4	42198	42209	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
57	NC_019628	GTAG	3	44444	44455	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	42869766
58	NC_019628	CCA	4	46268	46278	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	42869766
59	NC_019628	AAT	4	48358	48368	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
60	NC_019628	TTG	4	49885	49895	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42869766
61	NC_019628	AATT	3	50385	50396	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42869766
62	NC_019628	CTGT	3	50765	50776	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	42869766
63	NC_019628	ATT	4	51129	51140	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
64	NC_019628	TAT	4	51331	51343	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42869766
65	NC_019628	ATTTT	3	53412	53425	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42869766
66	NC_019628	ATT	4	53827	53838	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
67	NC_019628	CCCT	3	53996	54007	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	42869766
68	NC_019628	ATTT	3	54199	54210	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42869766
69	NC_019628	TAA	4	54225	54236	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
70	NC_019628	TTTG	3	55050	55060	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	42869766
71	NC_019628	TAA	4	56922	56932	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
72	NC_019628	AGC	4	57472	57483	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869766
73	NC_019628	GGAC	3	57519	57530	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	42869766
74	NC_019628	TAT	4	58767	58778	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
75	NC_019628	TAA	4	58782	58792	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869766
76	NC_019628	TTAA	3	59049	59059	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869766
77	NC_019628	AT	7	60138	60150	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42869766
78	NC_019628	AATA	3	60161	60171	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42869766
79	NC_019628	ATT	4	60556	60568	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42869766
80	NC_019628	TAAA	3	61156	61166	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42869766
81	NC_019628	AAAG	3	61315	61327	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	42869766
82	NC_019628	AGCA	3	62691	62702	12	50 %	0 %	25 %	25 %	8 %	42869766
83	NC_019628	GAAA	3	63125	63137	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	42869766
84	NC_019628	TAT	4	64957	64967	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42869766
85	NC_019628	ATA	4	65147	65158	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869766
86	NC_019628	AT	6	65182	65194	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42869766
87	NC_019628	AAGA	3	66673	66684	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42869766
88	NC_019628	TA	6	67900	67911	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42869766
89	NC_019628	TTA	4	68043	68054	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42869766
90	NC_019628	AT	6	68757	68767	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869771
91	NC_019628	TAA	4	69668	69678	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869771
92	NC_019628	G	12	73164	73175	12	0 %	0 %	100 %	0 %	8 %	42869771
93	NC_019628	AAAAT	3	74327	74341	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	42869771
94	NC_019628	ATA	4	74976	74986	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_019628	TA	8	76563	76577	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
96	NC_019628	TTTTC	3	77265	77278	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	42869772
97	NC_019628	CAAT	3	79228	79238	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42869772
98	NC_019628	AT	6	79818	79828	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
99	NC_019628	ACG	4	80565	80576	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42869772
100	NC_019628	ATTT	3	82134	82145	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42869773
101	NC_019628	AAAT	3	82517	82529	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_019628	TA	6	82725	82735	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_019628	AT	6	82867	82878	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_019628	TGAAG	3	83144	83157	14	40 %	20 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
105	NC_019628	TTC	4	85235	85245	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
106	NC_019628	A	12	85499	85510	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_019628	CTT	4	85706	85718	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
108	NC_019628	T	12	85847	85858	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019628	ACT	4	86865	86876	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019628	AGGT	3	88605	88616	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019628	TA	6	90432	90442	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_019628	TCAA	3	90574	90585	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
113	NC_019628	TA	7	93769	93781	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_019628	TAAT	3	93860	93871	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019628	TAA	7	94336	94356	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_019628	TA	6	95564	95574	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869773
117	NC_019628	C	17	97093	97109	17	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	42869773
118	NC_019628	ATT	4	97160	97170	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42869773
119	NC_019628	TTC	4	97716	97726	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42869773
120	NC_019628	GCCA	3	98313	98324	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	42869773
121	NC_019628	CTAA	3	102321	102332	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	42869774
122	NC_019628	TTCT	3	103040	103052	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	42869774
123	NC_019628	ATTTT	3	103905	103919	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	42869774
124	NC_019628	ATTT	3	104540	104551	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	42869774
125	NC_019628	TTCC	3	104598	104608	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	42869774
126	NC_019628	ATA	4	105195	105205	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42869774
127	NC_019628	GAAC	3	106734	106744	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	42869774
128	NC_019628	AT	7	107960	107972	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42869774
129	NC_019628	T	12	108152	108163	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	42869774
130	NC_019628	ATA	4	108363	108374	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42869774
131	NC_019628	TTGA	3	112469	112480	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
132	NC_019628	TA	6	112612	112622	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_019628	CTAC	3	114436	114447	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019628	AGT	4	116178	116189	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019628	A	15	117196	117210	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_019628	GAA	4	117335	117347	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_019628	ATTC	3	119894	119904	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
138	NC_019628	AACT	3	120162	120172	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
139	NC_019628	AT	6	120178	120189	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Pellia endiviifolia chloroplast