ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Spodoptera exigua mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019622	TTTAT	3	129	143	15	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_019622	T	17	278	294	17	0 %	100 %	0 %	5 %	42640626
3	NC_019622	ATT	7	687	706	20	33.33 %	66.67 %	0 %	10 %	42640626
4	NC_019622	AATT	3	784	794	11	50 %	50 %	0 %	9 %	42640626
5	NC_019622	ATTT	3	839	849	11	25 %	75 %	0 %	9 %	42640626
6	NC_019622	ATT	4	1025	1037	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	42640626
7	NC_019622	AT	6	1050	1060	11	50 %	50 %	0 %	9 %	42640626
8	NC_019622	TTAAAA	3	1164	1181	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	42640626
9	NC_019622	TTAA	3	1193	1203	11	50 %	50 %	0 %	9 %	42640626
10	NC_019622	TTTA	3	1246	1257	12	25 %	75 %	0 %	8 %	42640626
11	NC_019622	TAT	5	2026	2040	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	42640627
12	NC_019622	ATT	4	2852	2864	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	42640627
13	NC_019622	ATTT	3	2889	2900	12	25 %	75 %	0 %	8 %	42640627
14	NC_019622	TTTA	3	3187	3197	11	25 %	75 %	0 %	9 %	42640627
15	NC_019622	AATT	3	3265	3277	13	50 %	50 %	0 %	7 %	42640627
16	NC_019622	TTAA	3	3335	3347	13	50 %	50 %	0 %	7 %	42640627
17	NC_019622	AATT	3	3721	3731	11	50 %	50 %	0 %	9 %	42640627
18	NC_019622	ATT	4	3850	3861	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_019622	AATT	4	3893	3908	16	50 %	50 %	0 %	6 %	42640627
20	NC_019622	T	14	3915	3928	14	0 %	100 %	0 %	7 %	42640627
21	NC_019622	ATT	4	3955	3965	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	42640627
22	NC_019622	ATTT	3	4825	4836	12	25 %	75 %	0 %	8 %	42640627
23	NC_019622	TAT	5	5580	5593	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	42640627
24	NC_019622	ATATT	3	5951	5965	15	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019622	AAAT	3	6396	6406	11	75 %	25 %	0 %	9 %	42640627
26	NC_019622	TAAA	3	6408	6419	12	75 %	25 %	0 %	0 %	42640627
27	NC_019622	TAA	4	6669	6679	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42640627
28	NC_019622	TTA	4	7233	7244	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	42640627
29	NC_019622	ATA	7	7338	7358	21	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42640627
30	NC_019622	ATT	4	7541	7552	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	42640627
31	NC_019622	TAA	4	7776	7788	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	42640627
32	NC_019622	TAT	5	8035	8049	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	42640627
33	NC_019622	TTA	4	8088	8098	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	42640627
34	NC_019622	ATC	4	8464	8475	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42640627
35	NC_019622	TAAA	3	8987	8997	11	75 %	25 %	0 %	9 %	42640627
36	NC_019622	TTTA	3	9014	9024	11	25 %	75 %	0 %	9 %	42640627
37	NC_019622	AAT	5	9122	9137	16	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	42640627
38	NC_019622	AAAAT	3	9160	9173	14	80 %	20 %	0 %	7 %	42640627
39	NC_019622	AT	6	9349	9359	11	50 %	50 %	0 %	9 %	42640627
40	NC_019622	AT	14	9515	9541	27	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_019622	TAA	4	9552	9563	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42640627
42	NC_019622	AT	9	9668	9684	17	50 %	50 %	0 %	5 %	42640627
43	NC_019622	A	13	9709	9721	13	100 %	0 %	0 %	0 %	42640627
44	NC_019622	ATT	5	9955	9968	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_019622	TAA	5	10013	10027	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	42640627
46	NC_019622	ATT	5	10173	10187	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	42640627
47	NC_019622	AATT	3	10217	10228	12	50 %	50 %	0 %	8 %	42640627
48	NC_019622	TAA	5	10296	10309	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	42640627
49	NC_019622	ATA	4	10429	10440	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42640627
50	NC_019622	ATTT	4	10444	10459	16	25 %	75 %	0 %	6 %	42640627
51	NC_019622	TA	6	10696	10706	11	50 %	50 %	0 %	9 %	42640628
52	NC_019622	TAA	5	11109	11123	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	42640628
53	NC_019622	TTA	4	11129	11140	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	42640628
54	NC_019622	TAT	5	11236	11249	14	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	42640628
55	NC_019622	ATA	4	11772	11783	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	42640628
56	NC_019622	TA	6	11959	11969	11	50 %	50 %	0 %	9 %	42640628
57	NC_019622	TAAA	3	12157	12168	12	75 %	25 %	0 %	8 %	42640628
58	NC_019622	ATTA	3	12197	12208	12	50 %	50 %	0 %	8 %	42640628
59	NC_019622	TAAAA	3	12370	12383	14	80 %	20 %	0 %	7 %	42640628
60	NC_019622	TAA	4	12408	12418	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	42640628
61	NC_019622	TA	17	12776	12810	35	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_019622	AATTT	4	12849	12868	20	40 %	60 %	0 %	10 %	Non-Coding
63	NC_019622	AT	6	13488	13499	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_019622	TA	6	13607	13618	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_019622	AAATT	3	13619	13633	15	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019622	ATTA	4	13774	13789	16	50 %	50 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_019622	TTTCA	3	14017	14030	14	20 %	60 %	20 %	7 %	Non-Coding
68	NC_019622	AATT	3	14060	14071	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019622	TAT	5	14483	14497	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_019622	ATTT	3	14761	14773	13	25 %	75 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_019622	AAAAT	3	14953	14967	15	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_019622	T	23	15057	15079	23	0 %	100 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_019622	AATT	3	15106	15116	11	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_019622	AT	6	15241	15253	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_019622	AT	13	15270	15294	25	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Spodoptera exigua mitochondrion