ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rhyacionia leptotubula mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019619	TAAA	3	65	75	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_019619	TTTAT	3	126	140	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_019619	T	13	249	261	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42640623
4	NC_019619	TTTTA	3	282	295	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42640623
5	NC_019619	AATT	3	781	791	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640623
6	NC_019619	ATT	4	919	931	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640623
7	NC_019619	TTAA	3	959	969	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640623
8	NC_019619	TCAAAA	3	1161	1178	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	42640623
9	NC_019619	TTTAA	3	1262	1276	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_019619	TAT	4	1950	1961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640622
11	NC_019619	GGA	4	2119	2129	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	42640622
12	NC_019619	AAAT	3	3431	3443	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	42640622
13	NC_019619	AATT	3	3722	3732	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640622
14	NC_019619	TA	6	3827	3838	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_019619	T	17	3920	3936	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	42640622
16	NC_019619	AATT	3	3985	3996	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640622
17	NC_019619	TAATT	3	4078	4091	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	42640623
18	NC_019619	AATT	3	4396	4406	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640623
19	NC_019619	TAAA	5	4712	4731	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_019619	TATTTA	3	5532	5550	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
21	NC_019619	AAAT	3	6168	6178	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_019619	TAAA	6	6369	6393	25	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640623
23	NC_019619	TAAA	3	6419	6430	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	42640623
24	NC_019619	A	14	6958	6971	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	42640623
25	NC_019619	ATA	5	7349	7363	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42640623
26	NC_019619	ATA	4	7817	7828	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640623
27	NC_019619	TAT	4	8007	8017	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640623
28	NC_019619	A	12	8065	8076	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	42640623
29	NC_019619	TAA	4	8232	8246	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_019619	ATCTA	3	8387	8400	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
31	NC_019619	ATC	4	8471	8482	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
32	NC_019619	ATC	4	8662	8673	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	42640623
33	NC_019619	AATAT	3	9190	9204	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	42640623
34	NC_019619	AAAT	3	9269	9279	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42640623
35	NC_019619	AAAAT	3	9358	9371	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	42640623
36	NC_019619	TATAAA	4	9596	9619	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640623
37	NC_019619	AT	8	9819	9833	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	42640623
38	NC_019619	TAA	5	9853	9867	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42640623
39	NC_019619	TTTG	3	9996	10007	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	42640623
40	NC_019619	A	13	10029	10041	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_019619	ATT	5	10123	10137	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_019619	TAA	4	10178	10189	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640623
43	NC_019619	ATT	5	10332	10346	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42640623
44	NC_019619	T	13	10407	10419	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42640623
45	NC_019619	AAATT	4	10462	10480	19	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	42640623
46	NC_019619	TAA	7	10580	10600	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640623
47	NC_019619	AATT	3	10678	10688	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640623
48	NC_019619	T	14	10969	10982	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	42640623
49	NC_019619	TTA	4	11743	11753	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640623
50	NC_019619	A	14	12057	12070	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	42640623
51	NC_019619	TA	6	12117	12127	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640623
52	NC_019619	A	15	12527	12541	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	42640623
53	NC_019619	TCAT	3	13231	13242	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
54	NC_019619	AT	14	13267	13294	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_019619	AAAATT	3	13762	13778	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
56	NC_019619	AATTT	3	13917	13931	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_019619	ATTA	3	14041	14052	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019619	ATT	5	14254	14268	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_019619	TTAA	3	14467	14478	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_019619	TTTCAA	3	14501	14519	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
61	NC_019619	AATT	3	14829	14840	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_019619	AATTA	3	14899	14913	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
63	NC_019619	TTTA	3	14914	14925	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_019619	AATTT	3	14934	14948	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019619	TTAA	3	15057	15068	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_019619	T	18	15162	15179	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019619	A	13	15180	15192	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019619	AAAAT	3	15202	15216	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_019619	TA	6	15256	15267	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_019619	TA	6	15314	15324	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_019619	TA	6	15343	15353	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_019619	TA	6	15372	15382	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_019619	TA	6	15430	15440	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_019619	TA	6	15459	15469	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_019619	TA	6	15488	15498	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_019619	ATA	4	15525	15536	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019619	TA	6	15639	15651	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_019619	TAA	5	15660	15674	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_019619	ATTTA	4	15708	15728	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
80	NC_019619	ATATT	4	15730	15748	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
81	NC_019619	ATTT	3	15771	15782	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
82	NC_019619	TA	9	15792	15809	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_019619	ATAA	4	15854	15869	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

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All Imperfect Repeats of Rhyacionia leptotubula mitochondrion