ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Chrysopa pallens mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019618	CAAT	3	81	92	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_019618	AATT	3	94	105	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019618	TTAA	3	1361	1373	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_019618	TATAA	3	1779	1792	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	42640621
5	NC_019618	ATT	4	3345	3355	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640621
6	NC_019618	TATT	5	3952	3972	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42640621
7	NC_019618	AATT	3	3993	4003	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640621
8	NC_019618	ATT	4	4158	4168	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640621
9	NC_019618	ATTT	3	4412	4424	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	42640621
10	NC_019618	ATT	4	5628	5639	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640621
11	NC_019618	ATT	4	5832	5846	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	42640621
12	NC_019618	AATT	3	5943	5955	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42640621
13	NC_019618	TTTTA	3	6271	6285	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
14	NC_019618	ATAA	3	6355	6366	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	42640622
15	NC_019618	ATAAA	4	6924	6942	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	42640622
16	NC_019618	TAT	4	6943	6953	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640622
17	NC_019618	TGA	4	6961	6972	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	42640622
18	NC_019618	TTA	4	7221	7232	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640622
19	NC_019618	ATA	4	7332	7343	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640622
20	NC_019618	TAA	5	8035	8048	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640622
21	NC_019618	AAAT	3	8086	8097	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_019618	AAT	4	8318	8329	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640622
23	NC_019618	AAT	4	8735	8747	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42640622
24	NC_019618	ATAAAT	3	8928	8945	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	42640622
25	NC_019618	TAA	6	8962	8979	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	42640622
26	NC_019618	TAT	5	8982	8996	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	42640622
27	NC_019618	AAAT	4	9046	9060	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	42640622
28	NC_019618	AAAAT	4	9135	9154	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	42640622
29	NC_019618	TAA	5	9190	9204	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42640622
30	NC_019618	AAAAAT	3	9368	9385	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	42640622
31	NC_019618	AT	6	9418	9428	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640622
32	NC_019618	AAT	4	9449	9460	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640622
33	NC_019618	TA	6	9618	9628	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640622
34	NC_019618	ATA	4	9743	9753	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640622
35	NC_019618	TAT	4	10092	10103	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640622
36	NC_019618	ATTT	4	10333	10348	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	42640622
37	NC_019618	ATT	4	10768	10778	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640622
38	NC_019618	ATT	4	11113	11123	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640622
39	NC_019618	ATT	4	11130	11142	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640622
40	NC_019618	AATT	3	11642	11653	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640622
41	NC_019618	ATA	5	12120	12134	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42640622
42	NC_019618	TTAA	3	12719	12730	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019618	ATCA	3	12938	12949	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
44	NC_019618	AATT	3	13020	13031	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_019618	TATAAA	4	13044	13066	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
46	NC_019618	TTA	4	13333	13345	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_019618	TTA	4	13383	13394	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_019618	TTA	4	13515	13526	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_019618	TTAA	3	13816	13828	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_019618	AATTT	3	14457	14470	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_019618	TAT	4	15063	15074	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_019618	TTAATT	3	15146	15163	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
53	NC_019618	AAT	4	15244	15255	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_019618	TTAA	3	15370	15381	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_019618	AAAT	3	15386	15397	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_019618	TA	20	15423	15460	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_019618	A	12	15488	15499	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019618	TGAG	3	15522	15533	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_019618	AAAAC	3	15534	15548	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
60	NC_019618	TA	7	15577	15589	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_019618	AAAAT	3	15630	15644	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_019618	TA	7	15708	15720	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_019618	TA	8	15976	15991	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_019618	ATTAA	3	16025	16038	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_019618	ATA	4	16169	16180	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_019618	ATT	4	16500	16510	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_019618	TA	8	16574	16589	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Chrysopa pallens mitochondrion