ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Vaccinium macrocarpon plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019616	CATT	3	2726	2737	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42869758
2	NC_019616	TATC	3	4292	4303	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42869758
3	NC_019616	GAAA	3	8822	8833	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42869758
4	NC_019616	CTTT	3	9833	9844	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42869758
5	NC_019616	AAAT	3	12095	12105	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42869758
6	NC_019616	GTTT	3	12296	12308	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	42869758
7	NC_019616	GAAA	3	12537	12547	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42869758
8	NC_019616	TTAT	3	12577	12589	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	42869758
9	NC_019616	AATT	3	14928	14938	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42869758
10	NC_019616	ATGG	3	15291	15302	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	42869758
11	NC_019616	GAAA	3	16240	16252	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	42869758
12	NC_019616	TAAA	3	17520	17531	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42869758
13	NC_019616	CAAT	3	19192	19202	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42869758
14	NC_019616	GATC	3	20895	20907	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	42869758
15	NC_019616	TCAG	3	20993	21004	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	42869758
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19	NC_019616	GAAA	3	31195	31205	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	42869758
20	NC_019616	TTCA	3	31350	31361	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42869758
21	NC_019616	TTGT	3	32450	32461	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	42869758
22	NC_019616	ATTT	3	34581	34591	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	42869758
23	NC_019616	TTAC	3	35236	35246	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42869758
24	NC_019616	AAAG	3	35533	35544	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42869758
25	NC_019616	CAAA	3	36176	36187	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	42869758
26	NC_019616	TCTA	3	36992	37003	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42869758
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33	NC_019616	AATA	3	47638	47648	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42869758
34	NC_019616	GAAA	3	50487	50498	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42869758
35	NC_019616	AATG	3	56228	56239	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	42869758
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48	NC_019616	ATTG	3	90256	90266	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	42869758
49	NC_019616	CAAT	3	90284	90294	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42869758
50	NC_019616	CAAT	3	91937	91947	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	42869758
51	NC_019616	TTCT	3	93426	93436	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42869758
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59	NC_019616	TTGG	5	108851	108870	20	0 %	50 %	50 %	0 %	10 %	42869758
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64	NC_019616	AGGT	3	115218	115229	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	42869758
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113	NC_019616	CTAT	3	161493	161504	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42869758
114	NC_019616	CTTT	3	161525	161536	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	42869758
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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Vaccinium macrocarpon plastid