Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Vaccinium macrocarpon plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_019616GAA4161316241266.67 %0 %33.33 %0 %8 %42869758
2NC_019616AAG419695197061266.67 %0 %33.33 %0 %8 %42869758
3NC_019616AAG431003310141266.67 %0 %33.33 %0 %0 %42869758
4NC_019616GAA432689327001266.67 %0 %33.33 %0 %0 %42869758
5NC_019616AAT433260332721366.67 %33.33 %0 %0 %7 %42869758
6NC_019616ACA435296353061166.67 %0 %0 %33.33 %9 %42869758
7NC_019616TAA436629366401266.67 %33.33 %0 %0 %8 %42869758
8NC_019616AGA438740387501166.67 %0 %33.33 %0 %9 %42869758
9NC_019616TCT44078040791120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
10NC_019616TAG445299453101233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %42869758
11NC_019616TCT54572445737140 %66.67 %0 %33.33 %7 %42869758
12NC_019616CTT64577245789180 %66.67 %0 %33.33 %5 %42869758
13NC_019616CTT44581745828120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
14NC_019616CTT44607746088120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
15NC_019616TCT44627446285120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
16NC_019616ATC446378463891233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %42869758
17NC_019616AGA447173471841266.67 %0 %33.33 %0 %8 %42869758
18NC_019616ATG454735547451133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %42869758
19NC_019616GCA456633566441233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %42869758
20NC_019616AAT558341583541466.67 %33.33 %0 %0 %7 %42869758
21NC_019616TAA459138591501366.67 %33.33 %0 %0 %7 %42869758
22NC_019616TTA468541685521233.33 %66.67 %0 %0 %0 %42869758
23NC_019616GTT47657976590120 %66.67 %33.33 %0 %8 %42869758
24NC_019616TCA479598796081133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %42869758
25NC_019616TCT58392183935150 %66.67 %0 %33.33 %6 %42869758
26NC_019616ATT484969849791133.33 %66.67 %0 %0 %9 %42869758
27NC_019616AGA485034850441166.67 %0 %33.33 %0 %9 %42869758
28NC_019616TCT48547185482120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
29NC_019616TCT48747787488120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
30NC_019616CTA488089881001233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %42869758
31NC_019616ATC488252882621133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %42869758
32NC_019616GTT49169191701110 %66.67 %33.33 %0 %9 %42869758
33NC_019616GAA491755917661266.67 %0 %33.33 %0 %8 %42869758
34NC_019616CGA493390934011233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %42869758
35NC_019616AAT494735947471366.67 %33.33 %0 %0 %7 %42869758
36NC_019616ACA497084970951266.67 %0 %0 %33.33 %8 %42869758
37NC_019616ATA41043031043151366.67 %33.33 %0 %0 %7 %42869758
38NC_019616CTT4117954117965120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
39NC_019616CGT4122898122908110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %42869758
40NC_019616TTA41261581261701333.33 %66.67 %0 %0 %7 %42869758
41NC_019616AGA51265281265421566.67 %0 %33.33 %0 %6 %42869758
42NC_019616ATT41287891288011333.33 %66.67 %0 %0 %7 %42869758
43NC_019616ATG41340331340431133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %42869758
44NC_019616CTT4140987140998120 %66.67 %0 %33.33 %8 %42869758
45NC_019616GAA41410001410111266.67 %0 %33.33 %0 %8 %42869758
46NC_019616CTA41411241411351233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %42869758
47NC_019616TAA41418061418161166.67 %33.33 %0 %0 %9 %42869758
48NC_019616CAT41465551465651133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %42869758
49NC_019616TTC5154055154069150 %66.67 %0 %33.33 %6 %42869758
50NC_019616TTA41575671575771133.33 %66.67 %0 %0 %9 %42869758
51NC_019616ACG41576901577001133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %42869758
52NC_019616CTT5158563158576140 %66.67 %0 %33.33 %7 %42869758
53NC_019616CAG41758131758241233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %42869758