ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Austinogebia edulis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019606	TATAA	3	285	298	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	42640608
2	NC_019606	ATAG	3	1505	1516	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	42640608
3	NC_019606	CTG	4	2146	2157	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	42640608
4	NC_019606	ATT	4	2519	2530	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640608
5	NC_019606	TCT	4	3456	3467	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42640609
6	NC_019606	TCT	4	3611	3621	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	42640609
7	NC_019606	ATT	8	4183	4208	26	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640609
8	NC_019606	TAT	5	4230	4243	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640609
9	NC_019606	ATT	5	4474	4487	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640609
10	NC_019606	TAA	4	5025	5036	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640609
11	NC_019606	TTAA	3	5090	5100	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640609
12	NC_019606	ATA	7	6581	6601	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42640609
13	NC_019606	AT	6	6868	6879	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	42640609
14	NC_019606	AT	6	7099	7109	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640609
15	NC_019606	CTAAAA	3	7760	7778	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	42640609
16	NC_019606	AATT	3	8029	8041	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	42640609
17	NC_019606	AAAAT	3	8168	8182	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	42640609
18	NC_019606	TAT	4	8211	8222	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640609
19	NC_019606	ATA	4	8314	8325	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640609
20	NC_019606	AAAT	3	8330	8341	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42640609
21	NC_019606	AGA	4	8427	8437	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_019606	TACT	3	8497	8507	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	42640609
23	NC_019606	TTATA	3	8749	8762	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	42640609
24	NC_019606	AAT	4	8900	8911	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42640609
25	NC_019606	TCTT	3	9266	9276	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	42640609
26	NC_019606	AT	6	9322	9332	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42640609
27	NC_019606	ATT	4	9355	9366	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640609
28	NC_019606	TAT	4	9708	9719	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640609
29	NC_019606	TTA	5	10084	10097	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42640609
30	NC_019606	GATT	3	10133	10144	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	42640609
31	NC_019606	TAAAA	3	10451	10465	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	42640609
32	NC_019606	TAAA	3	11606	11617	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_019606	TTAA	3	11663	11674	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_019606	TAA	4	11692	11702	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_019606	TAT	4	12198	12208	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_019606	AATT	3	12595	12606	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_019606	AATTAA	3	12811	12829	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_019606	ATT	4	12840	12851	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_019606	TTTA	3	12934	12944	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_019606	TTTA	4	13438	13452	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_019606	TAAA	3	13451	13462	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019606	AT	6	13746	13757	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_019606	ATC	4	13767	13779	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
44	NC_019606	TTA	4	14041	14052	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_019606	TA	6	14157	14168	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_019606	AT	6	14370	14380	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_019606	TA	7	14388	14400	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_019606	TAT	4	14595	14606	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_019606	TAT	4	14822	14833	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640609
50	NC_019606	TAT	4	15551	15561	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42640609
51	NC_019606	ATT	4	15680	15691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42640609

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Austinogebia edulis mitochondrion