ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lucilia cuprina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_019573	TTCAT	3	809	822	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	42658098
2	NC_019573	ATTTT	3	908	921	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42658098
3	NC_019573	ATT	4	1010	1021	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42658098
4	NC_019573	TTTCA	3	1165	1178	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	42658098
5	NC_019573	AGG	4	2076	2087	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	42658098
6	NC_019573	ATTCA	3	2863	2877	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	42658098
7	NC_019573	ATT	5	3230	3243	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42658098
8	NC_019573	TAA	4	3691	3701	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42658098
9	NC_019573	ATT	4	3924	3936	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	42658098
10	NC_019573	TTTAT	3	4934	4947	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	42658098
11	NC_019573	TTAA	3	5465	5476	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	42658098
12	NC_019573	TA	6	5479	5489	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_019573	TTAA	3	5775	5785	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42658098
14	NC_019573	ATTTTA	3	5823	5840	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	42658098
15	NC_019573	TTA	4	5836	5846	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42658098
16	NC_019573	CTTT	3	6120	6130	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
17	NC_019573	ATT	4	6378	6388	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	42658098
18	NC_019573	AAT	4	6506	6518	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42658098
19	NC_019573	TAAA	3	6598	6609	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42658098
20	NC_019573	CAA	4	6644	6654	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	42658098
21	NC_019573	AAAG	3	6896	6907	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	42658098
22	NC_019573	AAG	4	7013	7024	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42658098
23	NC_019573	TTA	4	7184	7195	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42658098
24	NC_019573	ATA	6	7289	7305	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	42658098
25	NC_019573	TGAA	3	7377	7387	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	42658098
26	NC_019573	AAG	4	7433	7444	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	42658098
27	NC_019573	AAAT	3	7528	7538	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42658098
28	NC_019573	TAA	4	7727	7739	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42658098
29	NC_019573	GTAAAA	3	8168	8185	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	42658098
30	NC_019573	AAT	4	8290	8301	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42658098
31	NC_019573	TCTAAT	3	8691	8708	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	42658098
32	NC_019573	AAAT	3	8968	8978	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42658098
33	NC_019573	AAAT	3	9015	9025	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42658098
34	NC_019573	TCT	4	9126	9137	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	42658098
35	NC_019573	TAA	4	9144	9155	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42658098
36	NC_019573	TAA	4	9159	9169	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	42658098
37	NC_019573	TAA	4	9177	9188	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42658098
38	NC_019573	TAA	5	9357	9371	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	42658098
39	NC_019573	TAAA	5	9590	9608	19	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	42658099
40	NC_019573	TTTTAT	3	9910	9927	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	42658099
41	NC_019573	TTTA	3	10066	10077	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	42658099
42	NC_019573	TAA	4	10155	10166	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	42658099
43	NC_019573	TTA	4	10507	10518	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42658099
44	NC_019573	TACT	3	10720	10731	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	42658099
45	NC_019573	TTA	4	11122	11133	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	42658099
46	NC_019573	AGT	4	11379	11390	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	42658099
47	NC_019573	TTAA	3	11500	11510	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	42658099
48	NC_019573	TAAA	3	12077	12088	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	42658099
49	NC_019573	TAA	4	12514	12526	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	42658099
50	NC_019573	TAAA	3	12538	12548	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	42658099
51	NC_019573	TATAT	3	12635	12648	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_019573	TAAA	3	13096	13106	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_019573	TTAA	3	13383	13393	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_019573	TAA	4	13424	13436	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_019573	ATTT	4	13500	13515	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_019573	TTAA	5	13569	13589	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_019573	ATT	4	13858	13869	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_019573	ACT	4	14430	14441	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
59	NC_019573	ATT	4	14725	14737	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_019573	AAAT	3	14739	14750	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019573	TAAAT	3	14867	14880	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_019573	TAA	4	14922	14932	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_019573	TAA	4	14944	14956	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_019573	TTAA	3	14966	14976	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_019573	TAA	4	15100	15111	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_019573	TTAA	3	15143	15154	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_019573	TA	9	15213	15229	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_019573	TA	6	15263	15273	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_019573	T	23	15350	15372	23	0 %	100 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
70	NC_019573	TAAT	4	15498	15513	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
71	NC_019573	A	13	15534	15546	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019573	TTA	4	15684	15696	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_019573	AT	8	15724	15741	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_019573	TA	11	15759	15780	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_019573	ATA	4	15856	15867	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_019573	A	13	15864	15876	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_019573	A	24	15912	15935	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lucilia cuprina mitochondrion