ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cryptococcus neoformans var. grubii H99 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018792	GCA	4	1091	1102	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40876698
2	NC_018792	CTA	4	1209	1219	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	40876698
3	NC_018792	TTA	4	1255	1266	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40876698
4	NC_018792	TTC	4	2641	2652	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40876699
5	NC_018792	ATT	4	4690	4701	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_018792	TA	6	5145	5158	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_018792	TAAA	7	5184	5212	29	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_018792	ACAGTA	3	5683	5700	18	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	40876699
9	NC_018792	ATATTA	4	6216	6238	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018792	TAT	4	6410	6421	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018792	ATA	8	6523	6545	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018792	ATA	4	6561	6571	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_018792	AT	6	6653	6663	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_018792	AT	6	9272	9282	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_018792	TAT	4	9452	9462	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_018792	ATA	5	9549	9564	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_018792	AATC	3	10390	10400	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	40876699
18	NC_018792	TA	6	10524	10534	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018792	ACT	5	13380	13394	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	40876699
20	NC_018792	TAC	4	14696	14707	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40876699
21	NC_018792	AAT	4	14857	14867	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018792	TAAA	4	15037	15052	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
23	NC_018792	TGCTAT	4	15254	15276	23	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	8 %	40876699
24	NC_018792	TAAT	3	15702	15712	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_018792	TAT	4	16056	16068	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_018792	A	13	16145	16157	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_018792	ATT	4	16551	16562	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_018792	TA	6	16645	16655	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_018792	TTA	5	16707	16721	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_018792	TA	6	16717	16727	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_018792	TAA	9	16831	16856	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
32	NC_018792	TA	6	16864	16875	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_018792	TA	6	16905	16916	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_018792	TTC	4	18687	18699	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	40876699
35	NC_018792	ATTATA	4	19581	19603	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_018792	TA	9	19611	19628	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
37	NC_018792	TGG	4	20338	20349	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40876699
38	NC_018792	ATA	4	21253	21264	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40876699
39	NC_018792	AT	7	21313	21325	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_018792	ATA	4	21541	21551	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_018792	TAT	4	21983	21994	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40876699
42	NC_018792	TTAA	4	23893	23908	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018792	ATA	4	24050	24060	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_018792	ATA	5	24845	24859	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40876700
45	NC_018792	TA	7	24887	24900	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Cryptococcus neoformans var. grubii H99 mitochondrion