ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sarcophilus harrisii mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018788	TG	59	1	118	118	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018788	TGTATG	3	9	26	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
3	NC_018788	TG	16	121	152	32	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_018788	GTTC	3	3025	3036	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
5	NC_018788	ATA	4	4662	4673	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40877245
6	NC_018788	ATT	4	5028	5039	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40877245
7	NC_018788	CAT	4	5183	5194	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40877245
8	NC_018788	CAA	4	5440	5451	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	40877245
9	NC_018788	GGA	4	6612	6622	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	40877244
10	NC_018788	TAA	4	7572	7583	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018788	TATTAA	3	7755	7772	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40877245
12	NC_018788	ATA	4	8328	8339	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_018788	AAT	6	8708	8726	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	40877244
14	NC_018788	CAA	4	8821	8831	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	40877244
15	NC_018788	TCA	4	9513	9523	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	40877245
16	NC_018788	GTA	4	10154	10165	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40877245
17	NC_018788	TTAA	3	10461	10473	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_018788	TTA	4	11202	11213	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	40877245
19	NC_018788	TA	6	12036	12046	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40877245
20	NC_018788	CTTT	3	12313	12324	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_018788	ATT	4	12427	12438	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40877245
22	NC_018788	ATAC	3	12711	12722	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	40877245
23	NC_018788	CAT	4	12837	12847	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	40877245
24	NC_018788	AC	6	13586	13596	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	40877245
25	NC_018788	TAAT	4	16305	16319	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_018788	AT	7	16908	16920	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_018788	C	15	17025	17039	15	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
28	NC_018788	GTGTAT	3	17096	17113	18	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sarcophilus harrisii mitochondrion