ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fragaria mandshurica plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018767	CAG	4	963	974	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40883030
2	NC_018767	AAG	4	2068	2079	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_018767	AAT	4	4774	4785	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_018767	TAT	5	7097	7110	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_018767	ATA	4	7569	7579	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_018767	TAT	4	10368	10378	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_018767	TAA	4	10405	10416	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_018767	TAT	6	10426	10443	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
9	NC_018767	TAT	5	10450	10463	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_018767	TGT	4	17592	17603	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40883031
11	NC_018767	GTT	4	23068	23079	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40883031
12	NC_018767	TAC	4	29012	29022	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
13	NC_018767	ATA	4	30948	30958	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_018767	TAA	4	32338	32349	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_018767	TAT	4	32699	32710	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_018767	AAT	4	33110	33121	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_018767	TGC	4	35981	35992	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40883031
18	NC_018767	TCT	4	38075	38085	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	40883031
19	NC_018767	CAC	4	41198	41209	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	40883032
20	NC_018767	GCA	4	41518	41529	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40883032
21	NC_018767	TTA	4	52807	52818	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_018767	ATA	4	55745	55755	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40883032
23	NC_018767	TAT	4	56220	56230	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_018767	TTG	4	58127	58137	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_018767	ATT	4	67944	67956	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_018767	GAA	4	69621	69632	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_018767	TCC	4	73226	73236	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	40883034
28	NC_018767	TAT	4	73513	73525	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40883034
29	NC_018767	TCT	4	75111	75122	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40883034
30	NC_018767	TCT	4	79521	79532	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40883034
31	NC_018767	TTA	4	85553	85564	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40883034
32	NC_018767	CTT	4	85774	85785	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40883034
33	NC_018767	GAT	4	86242	86252	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40883034
34	NC_018767	TAT	4	86461	86472	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	40883034
35	NC_018767	GAT	4	87630	87640	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40883034
36	NC_018767	AAG	4	101356	101367	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_018767	GAA	5	110683	110697	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	40883036
38	NC_018767	TAA	4	112341	112352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40883036
39	NC_018767	AAG	4	113080	113091	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40883036
40	NC_018767	TAA	4	113785	113795	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40883036
41	NC_018767	TTC	5	121304	121318	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	40883037
42	NC_018767	TAT	4	121580	121590	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40883037
43	NC_018767	TTA	4	121666	121677	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40883037
44	NC_018767	ATT	4	121688	121698	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40883037
45	NC_018767	TAT	4	125917	125928	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_018767	ATC	4	127499	127509	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
47	NC_018767	ATA	5	127787	127800	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_018767	TAA	4	129226	129237	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Fragaria mandshurica plastid