ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Acleris fimbriana mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018754	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_018754	TTA	4	687	697	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40877205
3	NC_018754	AATT	3	798	808	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40877205
4	NC_018754	TAA	4	953	964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40877205
5	NC_018754	TAT	5	1112	1125	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40877205
6	NC_018754	T	13	1203	1215	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	40877205
7	NC_018754	TTTAA	3	1279	1293	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_018754	TTA	4	1373	1383	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_018754	AT	24	1397	1442	46	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018754	TATAA	3	1784	1797	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	40877205
11	NC_018754	GGA	4	2166	2176	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	40877205
12	NC_018754	GAAA	3	2284	2295	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	40877205
13	NC_018754	ATT	4	2900	2912	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40877205
14	NC_018754	AATT	3	3769	3779	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40877205
15	NC_018754	AATT	3	3871	3882	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_018754	T	17	3968	3984	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	40877205
17	NC_018754	TATTTT	4	3974	3997	24	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	8 %	40877205
18	NC_018754	ATT	4	4012	4022	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40877205
19	NC_018754	CTA	4	4119	4130	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40877205
20	NC_018754	AATT	3	4444	4454	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40877205
21	NC_018754	CTG	4	4695	4706	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40877205
22	NC_018754	ATTT	3	4889	4900	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40877206
23	NC_018754	TTA	4	4905	4915	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40877206
24	NC_018754	ATTT	4	5404	5419	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	40877206
25	NC_018754	TATTTA	3	5555	5573	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
26	NC_018754	ATT	4	5798	5809	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40877206
27	NC_018754	ATT	12	6006	6040	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_018754	TTTA	3	6395	6405	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_018754	TAAA	4	6478	6493	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	40877206
30	NC_018754	TAAA	3	6528	6539	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	40877206
31	NC_018754	ATATA	3	6559	6572	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	40877206
32	NC_018754	TTAA	3	6984	6995	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40877206
33	NC_018754	AT	6	7074	7085	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40877206
34	NC_018754	ATA	4	7458	7469	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40877206
35	NC_018754	TAA	4	7896	7908	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40877206
36	NC_018754	TAT	4	8116	8126	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40877206
37	NC_018754	TAAA	3	8140	8151	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40877206
38	NC_018754	A	22	8164	8185	22	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	40877206
39	NC_018754	TAA	4	8344	8358	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40877206
40	NC_018754	ATC	4	8490	8501	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40877206
41	NC_018754	ATC	4	8583	8594	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40877206
42	NC_018754	AAAT	3	9190	9200	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40877206
43	NC_018754	AAAAT	3	9279	9292	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	40877206
44	NC_018754	TA	7	9319	9331	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40877206
45	NC_018754	ATA	4	9537	9548	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40877206
46	NC_018754	AT	6	9737	9749	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40877206
47	NC_018754	AT	6	9751	9762	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40877206
48	NC_018754	TTAA	4	9815	9830	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	40877206
49	NC_018754	AATAAA	3	9867	9885	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	40877206
50	NC_018754	T	16	9923	9938	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_018754	ATT	5	10035	10049	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_018754	ATTTT	4	10208	10227	20	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	40877206
53	NC_018754	TTTA	3	10326	10337	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40877206
54	NC_018754	TAA	7	10495	10515	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40877206
55	NC_018754	TTTA	3	10516	10527	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40877206
56	NC_018754	TA	6	10771	10781	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40877206
57	NC_018754	TTA	4	11653	11663	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40877206
58	NC_018754	ATTA	3	11751	11766	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	40877206
59	NC_018754	AAATA	3	11998	12012	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	40877206
60	NC_018754	A	16	12440	12455	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	40877206
61	NC_018754	CTAATA	3	12725	12741	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	40877206
62	NC_018754	TA	17	12849	12881	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018754	T	13	13114	13126	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_018754	ATTT	3	13200	13212	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_018754	TA	24	13212	13257	46	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_018754	AATTTA	3	13304	13322	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
67	NC_018754	AATT	3	13332	13342	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_018754	TTAT	3	13707	13718	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_018754	ATTA	4	14011	14026	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_018754	AATT	3	14274	14285	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_018754	TAT	4	14590	14601	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_018754	AATT	3	14804	14815	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_018754	AATTT	3	14915	14929	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_018754	AAATA	3	15020	15034	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_018754	T	23	15143	15165	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_018754	TAT	4	15254	15265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_018754	TAT	4	15435	15446	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
78	NC_018754	TAT	4	15616	15627	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_018754	TAT	4	15797	15808	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Acleris fimbriana mitochondrion