Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Trebouxiophyceae sp. MX-AZ01 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018569CAA4591759281266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_018569CCA4765676661133.33 %0 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
3NC_018569TAC4921692261133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
4NC_018569TGC41874618757120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40905246
5NC_018569GTT52138921403150 %66.67 %33.33 %0 %6 %40905246
6NC_018569TCT42734227352110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40905247
7NC_018569GTG42911729129130 %33.33 %66.67 %0 %7 %Non-Coding
8NC_018569ATG435280352901133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40905247
9NC_018569GCT43732237333120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40905247
10NC_018569ACA440463404741266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
11NC_018569CTC44222842239120 %33.33 %0 %66.67 %8 %40905247
12NC_018569TGC55219152205150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %40905248
13NC_018569AGC456658566691233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
14NC_018569AGC456681566911133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
15NC_018569ACC456975569871333.33 %0 %0 %66.67 %7 %Non-Coding
16NC_018569GTG45956259572110 %33.33 %66.67 %0 %9 %40905248
17NC_018569TGC46383263843120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
18NC_018569TCA466195662061233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
19NC_018569CAT467815678261233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40905248
20NC_018569AGG469612696231233.33 %0 %66.67 %0 %8 %40905248
21NC_018569GGA569970699841533.33 %0 %66.67 %0 %6 %40905248
22NC_018569GTG47173071741120 %33.33 %66.67 %0 %8 %40905248
23NC_018569ACC473734737451233.33 %0 %0 %66.67 %8 %40905248
24NC_018569CGT47711877129120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
25NC_018569GGA484958849681133.33 %0 %66.67 %0 %9 %40905249
26NC_018569GGA487664876741133.33 %0 %66.67 %0 %9 %40905249
27NC_018569GCC48981389824120 %0 %33.33 %66.67 %8 %Non-Coding
28NC_018569GCA490388903981133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %40905249
29NC_018569CGC49070490715120 %0 %33.33 %66.67 %8 %Non-Coding
30NC_018569CCA492530925411233.33 %0 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
31NC_018569AGG496574965851233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
32NC_018569CTT49902799038120 %66.67 %0 %33.33 %0 %40905250
33NC_018569TGC49907299083120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40905250
34NC_018569GCC4100223100233110 %0 %33.33 %66.67 %9 %Non-Coding
35NC_018569GAT41171701171801133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40905251
36NC_018569AAG41173461173571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40905251
37NC_018569GGC4120879120890120 %0 %66.67 %33.33 %8 %Non-Coding
38NC_018569TCA41212201212311233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40905252
39NC_018569GAG41267461267571233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
40NC_018569GGT4128862128873120 %33.33 %66.67 %0 %8 %40905253
41NC_018569CAT41306461306561133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
42NC_018569AGC41320671320771133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
43NC_018569GGT4133805133816120 %33.33 %66.67 %0 %8 %40905253
44NC_018569CGG4134616134627120 %0 %66.67 %33.33 %8 %Non-Coding
45NC_018569AGG41357041357151233.33 %0 %66.67 %0 %8 %40905253
46NC_018569TGT4137298137308110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
47NC_018569TGC4137927137937110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
48NC_018569CTT4148277148288120 %66.67 %0 %33.33 %0 %40905254
49NC_018569GAA41483191483301266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40905254
50NC_018569GGC4148659148670120 %0 %66.67 %33.33 %8 %Non-Coding
51NC_018569TGG4148672148683120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding