Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Trebouxiophyceae sp. MX-AZ01 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018568GCTT334923503120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
2NC_018568GA6383138421250 %0 %50 %0 %8 %Non-Coding
3NC_018568ACCC4502150351525 %0 %0 %75 %6 %Non-Coding
4NC_018568CCA4526952801233.33 %0 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
5NC_018568GAT4601060201133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
6NC_018568ATGG3658865981125 %25 %50 %0 %9 %40905242
7NC_018568GTGG370547065120 %25 %75 %0 %8 %Non-Coding
8NC_018568CTGC371707181120 %25 %25 %50 %8 %Non-Coding
9NC_018568ATTG3758976001225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
10NC_018568CAGA3915091611250 %0 %25 %25 %8 %Non-Coding
11NC_018568GCAT3972697361125 %25 %25 %25 %9 %40905242
12NC_018568GAT410203102131133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_018568TA614708147181150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_018568TTGC31602216032110 %50 %25 %25 %9 %40905243
15NC_018568AG619005190161250 %0 %50 %0 %8 %40905243
16NC_018568GGGT31992519936120 %25 %75 %0 %8 %Non-Coding
17NC_018568TC62167821688110 %50 %0 %50 %9 %40905243
18NC_018568CCT42196321974120 %33.33 %0 %66.67 %8 %40905243
19NC_018568AGATG322983229971540 %20 %40 %0 %6 %40905243
20NC_018568AGA423601236111166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40905243
21NC_018568GCGTT32385123865150 %40 %40 %20 %0 %Non-Coding
22NC_018568GGCCT32418224196150 %20 %40 %40 %6 %Non-Coding
23NC_018568CT62505125061110 %50 %0 %50 %9 %40905243
24NC_018568TG72704227054130 %50 %50 %0 %7 %40905244
25NC_018568TCT42806828078110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40905244
26NC_018568CTGG32998930000120 %25 %50 %25 %8 %40905244
27NC_018568GCAGGA332276322931833.33 %0 %50 %16.67 %5 %40905244
28NC_018568GCTA335609356191125 %25 %25 %25 %9 %40905244
29NC_018568GAG435775357861233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
30NC_018568AACT336022360331250 %25 %0 %25 %8 %Non-Coding
31NC_018568GT63637836389120 %50 %50 %0 %8 %40905244
32NC_018568CCG43687336884120 %0 %33.33 %66.67 %8 %40905244
33NC_018568TCGGC33691436928150 %20 %40 %40 %6 %40905244
34NC_018568CTC43725637267120 %33.33 %0 %66.67 %8 %40905244
35NC_018568AAGA338504385151275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
36NC_018568AGAA338549385611375 %0 %25 %0 %7 %40905244
37NC_018568GCAC338983389941225 %0 %25 %50 %8 %40905244
38NC_018568AGAC341243412551350 %0 %25 %25 %7 %Non-Coding
39NC_018568TC64248742497110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
40NC_018568AGGT343729437401225 %25 %50 %0 %8 %Non-Coding
41NC_018568CAA544645446581466.67 %0 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
42NC_018568AGG444758447691233.33 %0 %66.67 %0 %8 %40905245
43NC_018568CTAT346596466061125 %50 %0 %25 %9 %40905245
44NC_018568AAGG348484484941150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
45NC_018568TG64849748507110 %50 %50 %0 %9 %Non-Coding
46NC_018568TCC45037050381120 %33.33 %0 %66.67 %8 %40905245
47NC_018568CAGG351309513201225 %0 %50 %25 %0 %Non-Coding
48NC_018568TCC45219552205110 %33.33 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
49NC_018568G125223952250120 %0 %100 %0 %0 %Non-Coding
50NC_018568CAA454233542441266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
51NC_018568ACA458074580841166.67 %0 %0 %33.33 %9 %40905245
52NC_018568AGAAG358263582761460 %0 %40 %0 %7 %40905245
53NC_018568CTT45943759448120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40905245
54NC_018568TCT45980559816120 %66.67 %0 %33.33 %0 %40905245
55NC_018568TA666647666571150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
56NC_018568GTG47011270123120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
57NC_018568CAAGC372713727261440 %0 %20 %40 %7 %Non-Coding
58NC_018568GAA473230732401166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40905246
59NC_018568AGA473277732881266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40905246