ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pachycladon enysii chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018565	TCT	4	712	722	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	40447459
2	NC_018565	TAA	4	1945	1955	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_018565	ATA	4	4667	4679	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_018565	TAA	4	4855	4866	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_018565	TTC	4	6462	6472	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
6	NC_018565	TTA	4	7861	7873	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_018565	AAT	4	12857	12868	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018565	ATA	4	13526	13536	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_018565	GAT	4	15103	15115	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	40447460
10	NC_018565	GTT	4	22955	22966	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40447460
11	NC_018565	TCA	4	25309	25319	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	40447460
12	NC_018565	TAT	5	28845	28859	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_018565	TAA	6	31536	31554	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_018565	TAT	4	32144	32154	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_018565	ATG	4	38581	38591	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40447461
16	NC_018565	GCA	4	40479	40490	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40447461
17	NC_018565	ATG	4	40805	40815	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40447461
18	NC_018565	AGA	7	43952	43972	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018565	TAG	4	44060	44070	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_018565	TAT	6	46463	46479	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_018565	TAT	5	49760	49774	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
22	NC_018565	TTA	4	50855	50866	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_018565	ATA	5	53772	53785	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40447461
24	NC_018565	TTG	4	54522	54532	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_018565	TCT	4	62633	62644	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_018565	ATA	6	64513	64530	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_018565	CTT	4	66242	66253	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_018565	TCT	4	77876	77886	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	40447463
29	NC_018565	ATC	4	81537	81547	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	40447463
30	NC_018565	GAT	4	84606	84616	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40447463
31	NC_018565	AGA	4	89752	89762	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	40447463
32	NC_018565	AAT	4	95103	95113	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40447463
33	NC_018565	TTC	4	98901	98912	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40447463
34	NC_018565	ATT	4	111077	111089	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40447463
35	NC_018565	TCT	4	111180	111190	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	40447463
36	NC_018565	AAG	4	111782	111793	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40447463
37	NC_018565	ACA	4	115243	115253	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	40447463
38	NC_018565	TAT	4	119319	119329	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40447463
39	NC_018565	AGA	4	125463	125473	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	40447463
40	NC_018565	TTG	4	126127	126138	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40447463
41	NC_018565	TTC	4	127223	127234	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40447463
42	NC_018565	GAA	4	139913	139924	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40447463
43	NC_018565	AGA	4	149517	149528	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40447467
44	NC_018565	ATC	4	154204	154214	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	40447467

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pachycladon enysii chloroplast