ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Malus x domestica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018554	CT	6	410	420	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40448168
2	NC_018554	AG	6	6906	6916	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_018554	TA	6	30501	30511	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448168
4	NC_018554	TG	6	31469	31481	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	40448168
5	NC_018554	CT	6	33404	33415	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
6	NC_018554	AC	7	49092	49104	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	40448167
7	NC_018554	AG	6	49597	49607	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
8	NC_018554	AG	6	53978	53988	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
9	NC_018554	GA	8	59672	59687	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	40448167
10	NC_018554	AT	6	65786	65796	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
11	NC_018554	AT	6	72679	72689	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
12	NC_018554	CT	6	74808	74819	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448167
13	NC_018554	AG	6	88535	88545	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
14	NC_018554	CT	6	98054	98064	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40448167
15	NC_018554	AT	6	103303	103313	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
16	NC_018554	TA	10	108421	108439	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	40448167
17	NC_018554	TA	6	109948	109958	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
18	NC_018554	AT	7	125158	125170	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448167
19	NC_018554	CT	7	128963	128976	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	40448167
20	NC_018554	AT	16	131060	131090	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
21	NC_018554	TC	6	142641	142651	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40448167
22	NC_018554	TA	6	149316	149326	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
23	NC_018554	CT	6	149865	149876	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448167
24	NC_018554	TG	6	153157	153168	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	40448167
25	NC_018554	AT	6	153546	153556	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
26	NC_018554	AG	6	173325	173336	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	40448167
27	NC_018554	TA	7	176007	176020	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448167
28	NC_018554	CG	6	177772	177783	12	0 %	0 %	50 %	50 %	8 %	40448167
29	NC_018554	GA	6	195339	195349	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
30	NC_018554	TC	6	199621	199632	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448167
31	NC_018554	GT	6	200407	200417	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	40448167
32	NC_018554	AG	6	214714	214724	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
33	NC_018554	TA	6	215850	215862	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448167
34	NC_018554	AG	8	224953	224968	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	40448167
35	NC_018554	GA	6	228228	228238	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
36	NC_018554	AG	6	231290	231300	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
37	NC_018554	AT	6	242169	242179	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
38	NC_018554	GA	7	244186	244198	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	40448167
39	NC_018554	TA	7	250203	250215	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448167
40	NC_018554	AT	6	257018	257028	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
41	NC_018554	GA	6	280921	280931	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018554	GA	6	286405	286415	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018554	TC	6	288353	288363	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
44	NC_018554	TG	6	301859	301869	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_018554	TA	6	312488	312501	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_018554	TC	6	317002	317013	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
47	NC_018554	CT	7	337633	337646	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
48	NC_018554	CT	6	344088	344098	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
49	NC_018554	CT	6	358039	358049	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
50	NC_018554	TA	6	366559	366569	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_018554	AT	6	374865	374876	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_018554	TA	6	384709	384720	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_018554	AG	7	390743	390756	14	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_018554	TA	6	394840	394850	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Malus x domestica mitochondrion