Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Malus x domestica mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018554CTT533033317150 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
2NC_018554CTT534583473160 %66.67 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
3NC_018554TTG489858996120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40448168
4NC_018554GAA410159101701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
5NC_018554GAA416558165691266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
6NC_018554CTT41855518565110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
7NC_018554GAA420754207641166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
8NC_018554GAA420769207801266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
9NC_018554ATA423490235001166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_018554CAT426293263031133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448168
11NC_018554ACT428397284071133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448168
12NC_018554AAC529701297141466.67 %0 %0 %33.33 %7 %40448168
13NC_018554TGC43016730178120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40448168
14NC_018554CTA431459314701233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448168
15NC_018554TCC43171631726110 %33.33 %0 %66.67 %9 %40448168
16NC_018554ACG432232322441333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %40448168
17NC_018554TGC43349533506120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
18NC_018554ATA435997360071166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_018554AAT436076360871266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_018554ACG440302403131233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
21NC_018554GAT541526415391433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
22NC_018554GCC44173741748120 %0 %33.33 %66.67 %8 %Non-Coding
23NC_018554TAA442396424061166.67 %33.33 %0 %0 %9 %40448167
24NC_018554AAT443236432471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
25NC_018554TAA443759437691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %40448167
26NC_018554CTT44891948930120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
27NC_018554ACT650435504521833.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %40448167
28NC_018554GGT45931659330150 %33.33 %66.67 %0 %6 %40448167
29NC_018554TCT46184561855110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
30NC_018554TAA462001620121266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
31NC_018554GGT46226162272120 %33.33 %66.67 %0 %8 %40448167
32NC_018554ATG462344623541133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448167
33NC_018554CTT46431864328110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
34NC_018554ATA465835658461266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
35NC_018554AAT467860678711266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
36NC_018554GAA569406694201566.67 %0 %33.33 %0 %6 %40448167
37NC_018554TAA477441774521266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
38NC_018554TCC48447784487110 %33.33 %0 %66.67 %9 %40448167
39NC_018554ATC488553885631133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448167
40NC_018554TGA488835888461233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40448167
41NC_018554TTA489788898001333.33 %66.67 %0 %0 %7 %40448167
42NC_018554GCT58998389997150 %33.33 %33.33 %33.33 %6 %40448167
43NC_018554GTG49113191142120 %33.33 %66.67 %0 %8 %40448167
44NC_018554CTT49213492146130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448167
45NC_018554GTA492649926601233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40448167
46NC_018554TAC494932949431233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
47NC_018554TTG4105850105861120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40448167
48NC_018554CTT4107958107969120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
49NC_018554TCT4109404109416130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448167
50NC_018554TCT4110275110285110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
51NC_018554AGA51170621170761566.67 %0 %33.33 %0 %6 %40448167
52NC_018554CCA41172341172441133.33 %0 %0 %66.67 %9 %40448167
53NC_018554TCA41205421205531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
54NC_018554GAT41218371218471133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448167
55NC_018554TCT4125843125854120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
56NC_018554TTC4126336126347120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
57NC_018554GAG41345381345481133.33 %0 %66.67 %0 %9 %40448167
58NC_018554TGG4136307136318120 %33.33 %66.67 %0 %8 %40448167
59NC_018554CCT4142045142056120 %33.33 %0 %66.67 %8 %40448167
60NC_018554AGA41428391428511366.67 %0 %33.33 %0 %7 %40448167
61NC_018554TCT4144150144161120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
62NC_018554CTT4145293145304120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
63NC_018554GAA51472611472741466.67 %0 %33.33 %0 %7 %40448167
64NC_018554TTA41526991527091133.33 %66.67 %0 %0 %9 %40448167
65NC_018554TAT41532621532731233.33 %66.67 %0 %0 %8 %40448167
66NC_018554GAA41568291568411366.67 %0 %33.33 %0 %7 %40448167
67NC_018554CAT41581601581711233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
68NC_018554CAG41583881583981133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %40448167
69NC_018554TCT4160364160375120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
70NC_018554ACA41623351623451166.67 %0 %0 %33.33 %9 %40448167
71NC_018554ATA41643361643471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
72NC_018554TTA41649091649201233.33 %66.67 %0 %0 %0 %40448167
73NC_018554CGG4165896165907120 %0 %66.67 %33.33 %8 %40448167
74NC_018554GAT41661361661471233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40448167
75NC_018554GAA41863221863331266.67 %0 %33.33 %0 %0 %40448167
76NC_018554TCT4187105187116120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
77NC_018554TTC4187581187591110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
78NC_018554ATC41897421897531233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
79NC_018554CAA51905001905141566.67 %0 %0 %33.33 %6 %40448167
80NC_018554GCA41972521972631233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %40448167
81NC_018554CTT4201583201594120 %66.67 %0 %33.33 %0 %40448167
82NC_018554GTT4205918205929120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40448167
83NC_018554TTC4206560206572130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448167
84NC_018554TTC4206824206835120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
85NC_018554TAC42118052118161233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
86NC_018554GTT4214690214701120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40448167
87NC_018554TCG5215340215353140 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %40448167
88NC_018554TCT4219544219554110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
89NC_018554AAG42210522210631266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
90NC_018554GAA42245492245601266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
91NC_018554AGG52247682247821533.33 %0 %66.67 %0 %6 %40448167
92NC_018554ATC52274742274871433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %40448167
93NC_018554TAA42278412278521266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
94NC_018554ATC42297012297111133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448167
95NC_018554CTG4230114230125120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40448167
96NC_018554CTA42392232392341233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
97NC_018554TAT42399572399681233.33 %66.67 %0 %0 %8 %40448167
98NC_018554TTA42400682400801333.33 %66.67 %0 %0 %7 %40448167
99NC_018554CTA42402472402581233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
100NC_018554TAG42419712419811133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448167
101NC_018554AGA42432432432541266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
102NC_018554CAC42498972499071133.33 %0 %0 %66.67 %9 %40448167
103NC_018554TAG52517142517271433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %40448167
104NC_018554CTG4253359253370120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40448167
105NC_018554CTT4253799253809110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
106NC_018554TCA42550842550951233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
107NC_018554CTC4255262255272110 %33.33 %0 %66.67 %9 %40448167
108NC_018554AGC42553152553261233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %40448167
109NC_018554TAA42586362586471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
110NC_018554AAC52660772660911566.67 %0 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
111NC_018554GTT4266218266228110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
112NC_018554TAA42685732685841266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
113NC_018554GCA42691402691511233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
114NC_018554CAG52695562695701533.33 %0 %33.33 %33.33 %6 %Non-Coding
115NC_018554GTT4269585269595110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
116NC_018554GAA42747882747991266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
117NC_018554AAC42762322762421166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
118NC_018554GAC42765322765431233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
119NC_018554GGT4276587276597110 %33.33 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
120NC_018554CAA52808482808621566.67 %0 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
121NC_018554TCT4288972288983120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
122NC_018554GAA42899632899731166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
123NC_018554GAT42931042931151233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
124NC_018554TGA42963532963631133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
125NC_018554TGC4300385300395110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
126NC_018554CTA43021683021781133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
127NC_018554CTC4304050304061120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
128NC_018554CAA43082293082401266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
129NC_018554AGA53086153086291566.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
130NC_018554GAG43086563086671233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
131NC_018554AAG43118803118901166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
132NC_018554CTT4319101319112120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
133NC_018554AGA43204593204701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
134NC_018554AGA53205823205951466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
135NC_018554GAA43227633227751366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
136NC_018554CCA43235413235521233.33 %0 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
137NC_018554TGC4327058327069120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
138NC_018554TAA43290343290451266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
139NC_018554AGG43319293319401233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
140NC_018554CTA43322223322321133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
141NC_018554TAA43326983327091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
142NC_018554TGA43353893353991133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
143NC_018554CTT4335795335806120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
144NC_018554TTC4339951339962120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
145NC_018554GAA43409113409231366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
146NC_018554TAG43424633424751333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
147NC_018554GAT43426503426611233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
148NC_018554GTA43460383460501333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
149NC_018554TGC4346186346198130 %33.33 %33.33 %33.33 %7 %Non-Coding
150NC_018554CCA43493823493931233.33 %0 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
151NC_018554TTC4349694349706130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
152NC_018554TTC4349958349969120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
153NC_018554AGT43576493576601233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
154NC_018554CCG4363096363106110 %0 %33.33 %66.67 %9 %Non-Coding
155NC_018554TTC4366039366051130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448170
156NC_018554GTC4366153366164120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40448170
157NC_018554TTC4366712366723120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
158NC_018554TGA43687613687711133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
159NC_018554TGG4369397369408120 %33.33 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
160NC_018554TCA43716043716151233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
161NC_018554GAA43722153722251166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
162NC_018554GAC43760523760621133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %Non-Coding
163NC_018554AGA43771973772081266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
164NC_018554CTT4377527377537110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
165NC_018554TAT43793883793991233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
166NC_018554ATA43795923796031266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
167NC_018554CTT4380774380785120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
168NC_018554CTC4383868383880130 %33.33 %0 %66.67 %7 %Non-Coding
169NC_018554GTA43916823916921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448170
170NC_018554AGA43938563938661166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
171NC_018554GAT43956483956581133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448170