Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Raphanus sativus mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018551TGC416661677120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
2NC_018551AGC4473647471233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
3NC_018551CAC4522252321133.33 %0 %0 %66.67 %9 %Non-Coding
4NC_018551GAA4570357141266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
5NC_018551AGA4706170711166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
6NC_018551ATT4841984301233.33 %66.67 %0 %0 %8 %40448166
7NC_018551CTT41083910849110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448166
8NC_018551TGC41398913999110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %40448166
9NC_018551CTT41620716219130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448166
10NC_018551GAA422425224371366.67 %0 %33.33 %0 %7 %40448166
11NC_018551TTC42441324423110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448166
12NC_018551CAT428323283331133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448166
13NC_018551ATC430009300191133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448166
14NC_018551TCC43073130742120 %33.33 %0 %66.67 %8 %40448166
15NC_018551TCC43281032822130 %33.33 %0 %66.67 %7 %40448166
16NC_018551TCT44039440405120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448166
17NC_018551CAC444241442511133.33 %0 %0 %66.67 %9 %40448166
18NC_018551TAC448529485401233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448166
19NC_018551TAT448552485631233.33 %66.67 %0 %0 %8 %40448166
20NC_018551TGA453525535351133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448166
21NC_018551TAT555412554271633.33 %66.67 %0 %0 %6 %40448166
22NC_018551CTT45622956241130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448166
23NC_018551TCT46012660137120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448166
24NC_018551GAA463554635651266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448166
25NC_018551ATC464023640331133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448166
26NC_018551GAA464333643441266.67 %0 %33.33 %0 %0 %40448166
27NC_018551GAA466166661761166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40448166
28NC_018551GAA466512665221166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40448166
29NC_018551TAA467693677031166.67 %33.33 %0 %0 %9 %40448166
30NC_018551GAA568538685521566.67 %0 %33.33 %0 %6 %40448166
31NC_018551CTT46858668597120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448166
32NC_018551CGC47202272032110 %0 %33.33 %66.67 %9 %40448166
33NC_018551TAT473355733671333.33 %66.67 %0 %0 %7 %40448166
34NC_018551CGA473515735261233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %40448166
35NC_018551AGA473625736371366.67 %0 %33.33 %0 %7 %40448166
36NC_018551AGG575427754411533.33 %0 %66.67 %0 %6 %40448166
37NC_018551CGA477052770621133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %40448166
38NC_018551TCT47844878459120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448166
39NC_018551TTC47894178952120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448166
40NC_018551TCT47973879749120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448166
41NC_018551TTC48014480156130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448166
42NC_018551CTT48195781969130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448166
43NC_018551TTC58295682970150 %66.67 %0 %33.33 %6 %40448166
44NC_018551GTT48456084571120 %66.67 %33.33 %0 %0 %40448166
45NC_018551CTA586386863991433.33 %33.33 %0 %33.33 %7 %40448166
46NC_018551AAG492517925271166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40448166
47NC_018551AGC492878928891233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %40448166
48NC_018551GAA493738937501366.67 %0 %33.33 %0 %7 %40448166
49NC_018551GAA496936969461166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40448166
50NC_018551AGG499438994501333.33 %0 %66.67 %0 %7 %40448166
51NC_018551CAG41031031031151333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %40448166
52NC_018551ATA41054231054331166.67 %33.33 %0 %0 %9 %40448166
53NC_018551TCA41081771081871133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448166
54NC_018551TCT4109354109366130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448166
55NC_018551TAT41157641157741133.33 %66.67 %0 %0 %9 %40448167
56NC_018551CTG4123600123611120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40448167
57NC_018551TTC4126573126584120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
58NC_018551ATA41297991298101266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40448167
59NC_018551TAG41325181325281133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448167
60NC_018551TCG4134251134261110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %40448167
61NC_018551TCC4134745134756120 %33.33 %0 %66.67 %8 %40448167
62NC_018551GGA41425581425691233.33 %0 %66.67 %0 %8 %40448167
63NC_018551TCA41435571435671133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448167
64NC_018551CTT4145304145316130 %66.67 %0 %33.33 %7 %40448167
65NC_018551TCT4150820150830110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
66NC_018551AGA41532531532641266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
67NC_018551GGA41539091539201233.33 %0 %66.67 %0 %8 %40448167
68NC_018551AGG41576661576761133.33 %0 %66.67 %0 %9 %40448167
69NC_018551AGC41583791583891133.33 %0 %33.33 %33.33 %9 %40448167
70NC_018551TCT4159562159573120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
71NC_018551ATA41598491598611366.67 %33.33 %0 %0 %7 %40448167
72NC_018551AGG51599991600131533.33 %0 %66.67 %0 %6 %40448167
73NC_018551GGA41601141601251233.33 %0 %66.67 %0 %8 %40448167
74NC_018551TGA41668631668741233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40448167
75NC_018551ATC41685921686031233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40448167
76NC_018551ACA41693911694021266.67 %0 %0 %33.33 %8 %40448167
77NC_018551CTG4175169175180120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40448167
78NC_018551TAG41765111765221233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40448167
79NC_018551CAA41785181785281166.67 %0 %0 %33.33 %9 %40448167
80NC_018551TTC4185167185177110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
81NC_018551GAA71875001875202166.67 %0 %33.33 %0 %0 %40448167
82NC_018551AAG41894901895011266.67 %0 %33.33 %0 %0 %40448167
83NC_018551TCT4190886190897120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
84NC_018551GAA41943141943251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
85NC_018551ATC41947831947931133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %40448167
86NC_018551GAA41950931951041266.67 %0 %33.33 %0 %0 %40448167
87NC_018551GAA41969261969361166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40448167
88NC_018551GAA41972721972821166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40448167
89NC_018551TAA41984531984631166.67 %33.33 %0 %0 %9 %40448167
90NC_018551GTA42010462010561133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40448167
91NC_018551AGA42023592023701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
92NC_018551CGC4203368203380130 %0 %33.33 %66.67 %7 %40448167
93NC_018551CTT4206159206170120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40448167
94NC_018551AAG42075822075931266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
95NC_018551TAG42091922092031233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40448167
96NC_018551CTT4210520210530110 %66.67 %0 %33.33 %9 %40448167
97NC_018551CGG4210925210936120 %0 %66.67 %33.33 %8 %40448167
98NC_018551CTA42157902158011233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
99NC_018551AGA42199342199461366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
100NC_018551TAC42207522207621133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
101NC_018551AGA42210462210581366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
102NC_018551ATA42214792214891166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
103NC_018551AAC42385622385731266.67 %0 %0 %33.33 %8 %40448167
104NC_018551AAG42389172389281266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
105NC_018551TGC4239030239041120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %40448167
106NC_018551ACG42411362411481333.33 %0 %33.33 %33.33 %7 %40448167
107NC_018551CAT42423472423571133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
108NC_018551TTG4245406245417120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40448167
109NC_018551AAG42454802454911266.67 %0 %33.33 %0 %8 %40448167
110NC_018551AGA42482662482761166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40448167
111NC_018551CTC8248805248828240 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
112NC_018551TAT42489632489751333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
113NC_018551GAA52516002516131466.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
114NC_018551CTT4253297253307110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding