ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Raphanus sativus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018551	TA	6	3504	3514	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018551	CT	6	14640	14651	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448166
3	NC_018551	AG	6	19712	19723	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	40448166
4	NC_018551	TA	6	31966	31976	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448166
5	NC_018551	TC	6	39951	39962	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448166
6	NC_018551	TC	6	42992	43003	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448166
7	NC_018551	TC	6	59781	59792	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448166
8	NC_018551	TA	7	70128	70140	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448166
9	NC_018551	AG	7	70237	70249	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	40448166
10	NC_018551	AT	7	77766	77779	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448166
11	NC_018551	TA	6	100432	100445	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448166
12	NC_018551	CT	7	109835	109848	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	40448166
13	NC_018551	AT	6	133646	133656	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
14	NC_018551	TC	7	142635	142648	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	40448167
15	NC_018551	CT	7	147633	147645	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	40448167
16	NC_018551	AG	8	148045	148060	16	50 %	0 %	50 %	0 %	6 %	40448167
17	NC_018551	AG	6	150370	150380	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
18	NC_018551	CT	6	152485	152495	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40448167
19	NC_018551	CA	6	169654	169665	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	40448167
20	NC_018551	TA	6	173434	173445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40448167
21	NC_018551	AC	6	177743	177753	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	40448167
22	NC_018551	TA	7	179714	179727	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40448167
23	NC_018551	TC	6	190541	190552	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40448167
24	NC_018551	TC	6	203713	203723	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40448167
25	NC_018551	AG	6	203734	203744	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40448167
26	NC_018551	TG	6	208183	208193	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	40448167
27	NC_018551	TA	6	222380	222390	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_018551	AT	6	226343	226354	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_018551	TA	6	239354	239364	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40448167
30	NC_018551	TA	7	243796	243810	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_018551	TC	6	252132	252142	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
32	NC_018551	AG	6	252590	252600	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_018551	CT	6	254415	254426	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Raphanus sativus mitochondrion