ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Leucoptera malifoliella mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018547	TAAA	3	63	73	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_018547	TATT	3	241	251	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40353156
3	NC_018547	TAT	4	293	304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353156
4	NC_018547	TTAA	3	477	487	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40353156
5	NC_018547	T	13	513	525	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	40353156
6	NC_018547	TAT	5	701	715	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40353156
7	NC_018547	AATT	3	785	795	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40353156
8	NC_018547	TAT	4	878	889	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353156
9	NC_018547	TAA	4	952	963	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353156
10	NC_018547	TAAT	4	1034	1049	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	40353156
11	NC_018547	ATT	4	1244	1255	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353156
12	NC_018547	TTAA	3	1264	1276	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_018547	TTTA	3	1307	1318	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_018547	GGA	4	2124	2134	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	40353156
15	NC_018547	GAAA	3	2242	2253	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	40353156
16	NC_018547	TTTG	3	2307	2317	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	40353156
17	NC_018547	T	12	3920	3931	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	40353157
18	NC_018547	ATT	4	3971	3982	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353157
19	NC_018547	TCTT	3	4085	4096	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	40353157
20	NC_018547	ATT	5	4867	4881	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40353157
21	NC_018547	T	15	4994	5008	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	40353157
22	NC_018547	ATA	5	5594	5608	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40353157
23	NC_018547	AATT	7	5921	5946	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40353157
24	NC_018547	ATT	4	6352	6363	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353157
25	NC_018547	AATA	4	6364	6379	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	40353157
26	NC_018547	TAAA	3	6398	6409	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40353157
27	NC_018547	ATA	5	6432	6447	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40353157
28	NC_018547	AAATTT	3	6627	6645	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	40353157
29	NC_018547	AAATT	4	6848	6868	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	40353157
30	NC_018547	ATAA	3	6942	6953	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40353157
31	NC_018547	TTA	4	7223	7234	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353157
32	NC_018547	TAA	4	7332	7343	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353157
33	NC_018547	TAA	4	7766	7778	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40353157
34	NC_018547	AAT	4	7974	7985	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353157
35	NC_018547	A	37	8003	8039	37	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	40353157
36	NC_018547	TAAAA	3	8040	8054	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	40353157
37	NC_018547	TATTT	3	8103	8117	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_018547	TAA	4	8217	8228	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353157
39	NC_018547	AAAT	3	9063	9073	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40353157
40	NC_018547	A	15	9150	9164	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	40353157
41	NC_018547	TAA	5	9207	9221	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40353157
42	NC_018547	A	12	9475	9486	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	40353157
43	NC_018547	ATT	5	9897	9910	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_018547	ATT	4	10007	10019	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40353157
45	NC_018547	ATA	5	10330	10343	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40353157
46	NC_018547	AAT	4	10346	10358	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40353157
47	NC_018547	ATTT	4	10368	10383	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	40353157
48	NC_018547	TA	6	10627	10637	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40353157
49	NC_018547	TAT	4	11032	11043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353157
50	NC_018547	AAT	5	11164	11178	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40353157
51	NC_018547	TAT	4	11190	11201	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353157
52	NC_018547	TAT	4	11362	11373	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353157
53	NC_018547	ATTA	4	11606	11621	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	40353157
54	NC_018547	AAT	4	11674	11684	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_018547	TAA	5	11721	11734	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40353157
56	NC_018547	ATT	5	11914	11928	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40353157
57	NC_018547	CCT	4	11974	11985	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	40353157
58	NC_018547	TATAA	3	12156	12169	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	40353157
59	NC_018547	A	13	12311	12323	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	40353157
60	NC_018547	ATTAA	4	12333	12352	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	40353157
61	NC_018547	AATAAA	3	12597	12615	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	40353157
62	NC_018547	AATC	3	13007	13017	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018547	TAAA	3	13030	13040	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_018547	TAT	4	13090	13100	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_018547	TTA	4	13445	13456	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_018547	TAT	4	13495	13505	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_018547	AAATT	4	13515	13534	20	60 %	40 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_018547	ATAA	4	13693	13708	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_018547	TTAA	3	13811	13822	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018547	AAT	4	13840	13850	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_018547	AATT	3	14075	14086	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_018547	TTAAAT	3	14625	14642	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_018547	TAATT	4	14675	14693	19	40 %	60 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
74	NC_018547	ATTT	3	14720	14731	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_018547	T	14	14904	14917	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_018547	TA	17	14971	15006	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_018547	TTTTA	4	15027	15046	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
78	NC_018547	TAT	5	15045	15059	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_018547	AT	11	15150	15172	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_018547	TTTTA	4	15197	15216	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_018547	TAT	5	15215	15229	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_018547	AT	8	15324	15340	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
83	NC_018547	TTTTA	4	15365	15384	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_018547	TAT	5	15383	15397	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_018547	AT	40	15478	15553	76	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_018547	TTTTA	4	15565	15584	20	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
87	NC_018547	TTTA	3	15600	15610	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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