ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tetrix japonica mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018543	ATTA	3	621	632	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40353147
2	NC_018543	TAA	4	872	883	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353147
3	NC_018543	TAT	5	1960	1974	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40353147
4	NC_018543	TCA	4	3017	3028	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40353147
5	NC_018543	TA	6	3234	3244	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40353147
6	NC_018543	TAA	4	3677	3688	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_018543	AAT	7	3858	3878	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40353147
8	NC_018543	TAT	4	4178	4189	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353147
9	NC_018543	AATT	3	4499	4511	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40353147
10	NC_018543	AAT	4	4699	4710	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353147
11	NC_018543	TAT	4	5759	5770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353147
12	NC_018543	ATAA	3	6229	6239	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40353147
13	NC_018543	ATA	4	6638	6649	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353147
14	NC_018543	A	17	6770	6786	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	40353147
15	NC_018543	TAAA	3	6787	6798	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40353147
16	NC_018543	ATA	4	7410	7422	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40353147
17	NC_018543	AT	6	7683	7693	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40353147
18	NC_018543	A	17	8161	8177	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	40353148
19	NC_018543	ATA	4	8410	8421	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353148
20	NC_018543	ATA	5	8564	8577	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40353148
21	NC_018543	AT	6	8723	8734	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40353148
22	NC_018543	TAA	4	9030	9040	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40353148
23	NC_018543	AGAAAA	3	9060	9077	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	40353148
24	NC_018543	CAA	4	9506	9517	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	40353148
25	NC_018543	ATA	4	9577	9588	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353148
26	NC_018543	ATT	5	9804	9817	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40353148
27	NC_018543	AT	6	9878	9888	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40353148
28	NC_018543	ATT	4	9975	9986	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353148
29	NC_018543	TA	7	10121	10133	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40353148
30	NC_018543	ATA	4	10140	10151	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40353148
31	NC_018543	CCATT	3	10883	10896	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	40353148
32	NC_018543	CAC	4	11019	11029	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	40353148
33	NC_018543	TATT	3	11432	11442	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40353148
34	NC_018543	AAAT	3	11446	11456	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40353148
35	NC_018543	AAAG	3	11815	11826	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	40353148
36	NC_018543	ATA	4	11910	11922	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40353148
37	NC_018543	ATTA	3	12324	12336	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40353148
38	NC_018543	CAAAA	3	12347	12360	14	80 %	0 %	0 %	20 %	7 %	40353148
39	NC_018543	TAA	4	12442	12453	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018543	AAAAT	3	12496	12510	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_018543	AT	11	13119	13139	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018543	TAAT	3	13242	13253	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_018543	AATA	3	14557	14567	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_018543	TTA	5	14615	14628	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_018543	ATA	5	14654	14668	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018543	CAAT	3	14795	14805	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
47	NC_018543	TAAAA	3	14895	14909	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tetrix japonica mitochondrion