Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Elodea canadensis chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_018541CAG49379481233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %40447439
2NC_018541CTT420052016120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40447439
3NC_018541TCT435533563110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
4NC_018541AAT4952495351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_018541CAA413701137111166.67 %0 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
6NC_018541TAA413720137301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
7NC_018541ATT414079140911333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
8NC_018541TTA414881148921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
9NC_018541ACT415088150991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40447439
10NC_018541ATG420794208051233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40447440
11NC_018541GTT42398323994120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40447440
12NC_018541AAT427647276571166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
13NC_018541ATT430274302841133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
14NC_018541ATT430297303071133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_018541TGA431641316521233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
16NC_018541GGA435520355301133.33 %0 %66.67 %0 %9 %40447440
17NC_018541TTG43580435814110 %66.67 %33.33 %0 %9 %40447440
18NC_018541AAT437213372281666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
19NC_018541ATG439918399281133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40447441
20NC_018541CTA441481414921233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40447441
21NC_018541TGC44152441534110 %33.33 %33.33 %33.33 %9 %40447441
22NC_018541GCA441816418271233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %40447441
23NC_018541TAA443403434151366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
24NC_018541TTA447670476801133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_018541ATT552993530071533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_018541GAA460522605341366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
27NC_018541TTA562439624531533.33 %66.67 %0 %0 %6 %Non-Coding
28NC_018541TTC46441764428120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40447442
29NC_018541ATA469239692511366.67 %33.33 %0 %0 %7 %40447443
30NC_018541AAG471670716801166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40447443
31NC_018541ACA475895759061266.67 %0 %0 %33.33 %8 %40447443
32NC_018541ATT485567855801433.33 %66.67 %0 %0 %7 %40447443
33NC_018541CTT48616386174120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40447443
34NC_018541GAT488001880111133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %40447443
35NC_018541GAT490762907731233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40447443
36NC_018541ACA593338933521566.67 %0 %0 %33.33 %6 %40447443
37NC_018541TAC499979999901233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40447443
38NC_018541GAA51115241115381566.67 %0 %33.33 %0 %6 %40447443
39NC_018541TAG41126461126571233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40447443
40NC_018541TAG41127121127231233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40447443
41NC_018541TAG41127451127561233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40447443
42NC_018541GAA41129181129281166.67 %0 %33.33 %0 %9 %40447443
43NC_018541TTG4115084115095120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40447443
44NC_018541ATT61153201153381933.33 %66.67 %0 %0 %10 %40447443
45NC_018541ATT41164801164911233.33 %66.67 %0 %0 %0 %40447443
46NC_018541TAT41168971169071133.33 %66.67 %0 %0 %9 %40447443
47NC_018541TAA81204501204722366.67 %33.33 %0 %0 %8 %40447443
48NC_018541ATA41210371210491366.67 %33.33 %0 %0 %7 %40447443
49NC_018541ATA41233051233161266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40447443
50NC_018541TCA41252981253091233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40447443
51NC_018541ATA41265611265711166.67 %33.33 %0 %0 %9 %40447443
52NC_018541ATA41265861265971266.67 %33.33 %0 %0 %8 %40447443
53NC_018541GTT4127584127595120 %66.67 %33.33 %0 %8 %40447443
54NC_018541TTA41292391292501233.33 %66.67 %0 %0 %8 %40447443
55NC_018541TCT4131120131131120 %66.67 %0 %33.33 %8 %40447443
56NC_018541GTA41426641426751233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %40447443
57NC_018541TGT5149302149316150 %66.67 %33.33 %0 %6 %40447447
58NC_018541ATC41518811518921233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %40447447