ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Elodea canadensis chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018541	AT	6	4166	4178	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_018541	AT	6	5174	5184	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447439
3	NC_018541	TA	7	6381	6393	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_018541	AT	6	6434	6445	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_018541	TA	6	6507	6519	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_018541	AT	6	6570	6580	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_018541	AT	6	7114	7124	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_018541	AT	6	7168	7178	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_018541	GA	6	8383	8394	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_018541	TA	6	10092	10102	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_018541	TA	6	13088	13098	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447439
12	NC_018541	AT	6	27338	27348	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_018541	AT	7	28006	28018	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_018541	AT	6	30148	30158	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_018541	AT	6	32851	32862	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_018541	AG	6	36492	36502	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_018541	AT	11	37585	37604	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
18	NC_018541	TA	9	47114	47131	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_018541	TA	6	49496	49507	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_018541	TA	6	51960	51971	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_018541	AT	6	52088	52098	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018541	TA	6	52108	52119	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_018541	AT	6	63619	63629	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447442
24	NC_018541	TA	6	69254	69264	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447443
25	NC_018541	AT	6	69926	69936	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018541	AT	6	71199	71209	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447443
27	NC_018541	AT	6	81608	81621	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40447443
28	NC_018541	TA	7	83174	83186	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40447443
29	NC_018541	TA	10	83309	83330	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447443
30	NC_018541	AT	6	85505	85515	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447443
31	NC_018541	TA	6	85698	85709	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40447443
32	NC_018541	GA	6	91187	91197	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40447443
33	NC_018541	AT	6	95827	95839	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40447443
34	NC_018541	GA	6	101052	101062	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40447443
35	NC_018541	CT	6	110686	110696	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40447443
36	NC_018541	TC	6	125601	125612	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	40447443
37	NC_018541	AT	6	128094	128104	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40447443
38	NC_018541	AG	6	131958	131968	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	40447443
39	NC_018541	AT	7	146815	146827	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_018541	TC	6	151457	151467	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40447447

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Elodea canadensis chloroplast