ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Challia fletcheri mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018538	GAT	4	422	433	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40353134
2	NC_018538	TAT	4	909	919	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40353134
3	NC_018538	TTA	4	1105	1116	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_018538	TTA	4	4608	4619	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353134
5	NC_018538	TTGG	3	5122	5133	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	40353134
6	NC_018538	GTTT	3	5135	5145	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	40353134
7	NC_018538	GGA	4	7453	7464	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	40353134
8	NC_018538	TAT	4	7517	7528	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353134
9	NC_018538	ATTT	3	7742	7752	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40353134
10	NC_018538	ATT	4	7759	7770	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353134
11	NC_018538	TTTAG	3	8265	8278	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	40353134
12	NC_018538	TA	8	8416	8430	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_018538	TATT	3	8529	8539	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40353134
14	NC_018538	TCT	4	8606	8617	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40353134
15	NC_018538	TA	6	9093	9105	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_018538	ATT	4	10699	10710	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40353134
17	NC_018538	TAT	5	11271	11285	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40353134
18	NC_018538	TA	7	13355	13370	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_018538	ATTTT	4	13581	13599	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	40353135
20	NC_018538	TA	6	13718	13729	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40353135
21	NC_018538	TGTT	3	13862	13873	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	40353135
22	NC_018538	GATT	3	13898	13908	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	40353135
23	NC_018538	TA	16	13992	14022	31	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_018538	TTGG	3	14371	14382	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	40353135
25	NC_018538	TGT	4	14609	14619	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	40353135
26	NC_018538	ATTT	3	14622	14632	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40353135
27	NC_018538	TATT	3	14852	14862	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40353135
28	NC_018538	TA	6	15110	15120	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40353135
29	NC_018538	TA	6	15139	15150	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40353135
30	NC_018538	AT	7	15250	15263	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_018538	TA	6	15423	15433	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_018538	GAT	4	16338	16349	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40353135
33	NC_018538	GAAA	3	16521	16532	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_018538	TTTA	3	17117	17129	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_018538	AAT	6	17409	17427	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
36	NC_018538	TA	6	17973	17984	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_018538	ATT	4	18037	18048	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_018538	TAT	4	18272	18283	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018538	TGTT	3	18389	18399	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_018538	TA	7	18406	18419	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_018538	TA	10	18776	18796	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018538	AT	9	18804	18821	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_018538	TA	7	18824	18838	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_018538	AT	8	18842	18857	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
45	NC_018538	TAA	5	18866	18880	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018538	ATT	4	18885	18896	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_018538	ATAAT	4	18900	18920	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_018538	TAA	4	18917	18928	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_018538	TA	7	18966	18979	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_018538	TA	12	18992	19013	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_018538	TA	7	19062	19074	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_018538	TA	7	19080	19092	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_018538	AT	8	19101	19116	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_018538	AT	13	19130	19154	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_018538	TAA	5	19163	19177	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_018538	ATT	4	19182	19193	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_018538	ATAAT	4	19197	19217	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_018538	TAA	4	19214	19225	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_018538	TA	7	19263	19276	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_018538	TA	12	19289	19310	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_018538	TA	7	19359	19371	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_018538	TA	7	19377	19389	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_018538	AT	8	19398	19413	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_018538	AT	13	19427	19451	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_018538	TAA	5	19460	19474	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
66	NC_018538	ATT	4	19479	19490	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_018538	ATAAT	4	19494	19514	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_018538	TAA	4	19511	19522	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_018538	TA	7	19560	19573	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_018538	TA	12	19586	19607	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_018538	TA	7	19656	19668	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_018538	TA	7	19674	19686	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_018538	AT	8	19695	19710	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_018538	AT	13	19724	19748	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_018538	TAA	5	19757	19771	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_018538	ATT	4	19776	19787	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_018538	ATAAT	4	19791	19811	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_018538	TAA	4	19808	19819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_018538	TA	7	19857	19870	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_018538	TA	13	19883	19906	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_018538	TA	8	19955	19969	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
82	NC_018538	TA	7	19975	19987	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
83	NC_018538	AT	7	19991	20003	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
84	NC_018538	AT	12	20023	20045	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_018538	TA	6	20071	20081	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_018538	TA	7	20136	20148	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
87	NC_018538	AT	7	20165	20177	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_018538	A	13	20232	20244	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_018538	TAA	4	20294	20304	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_018538	AAAT	3	20357	20368	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_018538	GGGCGC	3	20374	20391	18	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding

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