ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Frankliniella occidentalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018370	TAA	5	92	106	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020189
2	NC_018370	T	15	224	238	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	40020189
3	NC_018370	T	20	752	771	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018370	TA	6	802	813	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_018370	T	14	812	825	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018370	A	12	939	950	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018370	T	12	1908	1919	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	40020189
8	NC_018370	TTAT	3	1923	1933	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020189
9	NC_018370	T	13	2203	2215	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	40020189
10	NC_018370	T	20	2323	2342	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018370	TA	6	2373	2384	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018370	T	15	2383	2397	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018370	TTTTA	3	2882	2895	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	40020189
14	NC_018370	ATA	4	2946	2957	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020189
15	NC_018370	AAT	4	3065	3076	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020189
16	NC_018370	T	15	4499	4513	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	40020190
17	NC_018370	TTTA	3	4609	4620	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020190
18	NC_018370	AGT	4	4702	4712	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018370	AATT	3	4742	4752	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_018370	T	20	6651	6670	20	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018370	TA	6	6701	6712	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_018370	T	15	6711	6725	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018370	A	12	6830	6841	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	40020190
24	NC_018370	ATA	4	6899	6909	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020190
25	NC_018370	TAAA	3	7355	7366	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	40020190
26	NC_018370	AAAT	3	8454	8465	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_018370	AACA	3	8805	8815	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	40020190
28	NC_018370	ATT	4	8945	8956	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020190
29	NC_018370	AAAT	3	9326	9337	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	40020190
30	NC_018370	AAT	4	9466	9478	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020190
31	NC_018370	TAA	4	9655	9665	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020190
32	NC_018370	AAAG	3	9958	9969	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	40020190
33	NC_018370	AGAAA	3	10039	10053	15	80 %	0 %	20 %	0 %	0 %	40020190
34	NC_018370	AT	6	10380	10390	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020190
35	NC_018370	TAAA	3	10542	10553	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020190
36	NC_018370	TTA	4	10643	10654	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020190
37	NC_018370	A	13	10976	10988	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_018370	ATTTTA	3	11157	11174	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_018370	T	12	11186	11197	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018370	A	16	11255	11270	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_018370	TAAA	3	11557	11568	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_018370	AATT	3	11908	11919	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_018370	TAT	4	12511	12522	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020190
44	NC_018370	TTTTAA	3	13463	13481	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	40020190
45	NC_018370	TAATTA	3	13521	13538	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020190
46	NC_018370	AT	6	13917	13927	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020190
47	NC_018370	TATTT	3	14146	14161	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	40020190
48	NC_018370	TTAA	3	14613	14624	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Frankliniella occidentalis mitochondrion