ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ixodes ricinus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018369	ATA	4	168	178	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	40025670
2	NC_018369	ATTT	4	474	489	16	25 %	75 %	0 %	6 %	40025670
3	NC_018369	ATT	5	1001	1015	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	40025670
4	NC_018369	AAT	5	1018	1032	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	40025670
5	NC_018369	AATT	3	1455	1466	12	50 %	50 %	0 %	8 %	40025670
6	NC_018369	ATT	4	2622	2633	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40025670
7	NC_018369	TTAA	4	2748	2763	16	50 %	50 %	0 %	6 %	40025670
8	NC_018369	AAT	4	2847	2858	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	43233231
9	NC_018369	TAT	4	2856	2867	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	43233231
10	NC_018369	AATT	3	2976	2988	13	50 %	50 %	0 %	7 %	43233231
11	NC_018369	ATTAT	3	3804	3817	14	40 %	60 %	0 %	7 %	40025671
12	NC_018369	TAA	5	4088	4101	14	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	40025671
13	NC_018369	TAT	4	4295	4305	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	40025671
14	NC_018369	T	15	4663	4677	15	0 %	100 %	0 %	6 %	40025671
15	NC_018369	TAA	4	4844	4855	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40025671
16	NC_018369	ATT	4	5138	5149	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40025671
17	NC_018369	ATT	5	5251	5265	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	40025671
18	NC_018369	ATC	4	5434	5445	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40025671
19	NC_018369	AAAT	3	6178	6188	11	75 %	25 %	0 %	9 %	40025671
20	NC_018369	AT	6	6217	6227	11	50 %	50 %	0 %	9 %	40025671
21	NC_018369	ATTAAA	3	6250	6273	24	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40025671
22	NC_018369	TAAA	3	6363	6373	11	75 %	25 %	0 %	9 %	40025671
23	NC_018369	AAATA	3	6378	6392	15	80 %	20 %	0 %	6 %	40025671
24	NC_018369	CTAA	3	6800	6811	12	50 %	25 %	25 %	8 %	40025671
25	NC_018369	TAA	4	7317	7328	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40025671
26	NC_018369	ATAAAA	4	7550	7573	24	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	40025671
27	NC_018369	ATTT	3	7645	7655	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_018369	AAT	4	7849	7860	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	43233231
29	NC_018369	TAA	5	8100	8114	15	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	43233231
30	NC_018369	ATA	4	8266	8276	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	43233231
31	NC_018369	TAT	4	8451	8462	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	43233231
32	NC_018369	TAA	4	8483	8494	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	43233231
33	NC_018369	ATA	4	8635	8646	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	43233231
34	NC_018369	TAAA	3	9158	9169	12	75 %	25 %	0 %	8 %	40025671
35	NC_018369	TA	6	9444	9456	13	50 %	50 %	0 %	7 %	40025671
36	NC_018369	TTA	4	9576	9586	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	40025671
37	NC_018369	TCT	4	9712	9723	12	0 %	66.67 %	33.33 %	8 %	40025671
38	NC_018369	AATA	3	10722	10732	11	75 %	25 %	0 %	9 %	40025671
39	NC_018369	TTTC	3	10877	10887	11	0 %	75 %	25 %	9 %	40025671
40	NC_018369	ATA	4	11002	11013	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	54268721
41	NC_018369	ATT	4	11155	11166	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	54268721
42	NC_018369	CAAA	4	11353	11367	15	75 %	0 %	25 %	6 %	54268721
43	NC_018369	TA	6	11703	11714	12	50 %	50 %	0 %	8 %	54268721
44	NC_018369	AAAT	3	12422	12432	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_018369	TAAAT	3	13190	13203	14	60 %	40 %	0 %	7 %	Non-Coding
46	NC_018369	TTTA	3	13238	13248	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_018369	AATT	3	13502	13514	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_018369	TTA	4	13864	13875	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_018369	ATTT	3	14058	14068	11	25 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_018369	AT	7	14103	14115	13	50 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_018369	TAAA	3	14411	14421	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ixodes ricinus mitochondrion