ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Lentinula edodes mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018365	ACAAAA	4	678	701	24	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018365	TCCAGA	3	13626	13643	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
3	NC_018365	TTTTTC	3	16589	16606	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
4	NC_018365	GTAGCA	7	18227	18268	42	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
5	NC_018365	ATTTAA	3	19306	19323	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020183
6	NC_018365	ATAATT	3	20101	20118	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018365	TACTTA	4	20969	20992	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
8	NC_018365	TATTAA	3	22992	23009	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020183
9	NC_018365	TTTATT	9	25366	25418	53	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018365	ATAATT	3	32733	32751	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
11	NC_018365	ATATAA	3	34147	34164	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
12	NC_018365	AAATAA	3	34662	34679	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
13	NC_018365	TAAAAA	3	35106	35123	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
14	NC_018365	ATAAAA	3	35304	35321	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
15	NC_018365	AAATTA	3	37116	37133	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	40020183
16	NC_018365	TACATA	4	37609	37632	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	40020183
17	NC_018365	TTACCC	3	38006	38023	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	40020183
18	NC_018365	TTTTAC	3	43845	43862	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	40020183
19	NC_018365	TATAAG	10	47124	47183	60	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_018365	TAAAAG	3	47618	47635	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_018365	GGAGTA	3	49275	49293	19	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
22	NC_018365	CCTTCC	3	49372	49390	19	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10 %	Non-Coding
23	NC_018365	ATATTT	13	50019	50094	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_018365	TAAATA	3	50287	50303	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_018365	TATAAT	4	57389	57412	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_018365	ATAAAA	3	61051	61068	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
27	NC_018365	TCCTAA	4	65513	65536	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
28	NC_018365	ATATTA	3	68112	68128	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
29	NC_018365	TTTTAT	3	70006	70023	18	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
30	NC_018365	ATATAA	4	72534	72557	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
31	NC_018365	ATAAAG	3	72563	72580	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_018365	TTTCTT	3	73616	73633	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
33	NC_018365	AAAAAT	4	75146	75169	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	40020184
34	NC_018365	AAAATT	3	75292	75310	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	40020184
35	NC_018365	AATTTA	3	75362	75379	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020184
36	NC_018365	GAGTAG	22	79755	79886	132	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	4 %	Non-Coding
37	NC_018365	ATTAAA	4	80998	81023	26	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_018365	ATGTAA	3	82839	82856	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	40020184
39	NC_018365	TAATTT	3	85636	85653	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
40	NC_018365	TACTCC	9	86050	86102	53	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
41	NC_018365	TATATT	3	87570	87592	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_018365	ATAAAA	3	87820	87837	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
43	NC_018365	TAAATA	3	88004	88021	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
44	NC_018365	TTAGCT	4	89170	89193	24	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018365	TTATAT	5	89334	89363	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018365	TACACA	4	92011	92034	24	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
47	NC_018365	TATTTA	3	93816	93833	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_018365	AAGCTT	3	96253	96270	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
49	NC_018365	TAAATT	3	103644	103661	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018365	TATAGA	11	107622	107687	66	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_018365	TTTTAA	3	109779	109796	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_018365	AGAAAC	3	110047	110064	18	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
53	NC_018365	TATATT	4	110864	110886	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_018365	ATTTAG	4	116050	116073	24	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	8 %	40020185
55	NC_018365	AGAAAA	3	117068	117085	18	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	40020185
56	NC_018365	TATGTG	3	118956	118974	19	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	5 %	40020185
57	NC_018365	GGATTA	5	121141	121176	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Lentinula edodes mitochondrion