ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lentinula edodes mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018365	ATA	4	1601	1611	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020182
2	NC_018365	TTA	4	3747	3761	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020182
3	NC_018365	TAT	6	4162	4180	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	40020182
4	NC_018365	TAT	4	6254	6265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
5	NC_018365	TAT	4	6330	6341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
6	NC_018365	AGG	4	7353	7363	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	40020182
7	NC_018365	ATT	5	8814	8828	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020182
8	NC_018365	TAT	4	9114	9124	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_018365	AAT	4	10472	10482	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018365	AAT	5	11646	11660	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020182
11	NC_018365	ATT	4	11762	11772	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020182
12	NC_018365	GAG	4	13510	13521	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_018365	TCT	9	13567	13593	27	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
14	NC_018365	TCC	4	13594	13605	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
15	NC_018365	AAT	4	13954	13965	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_018365	TCC	4	14826	14836	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
17	NC_018365	AAT	4	15248	15259	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018365	TTA	4	15336	15348	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_018365	TAT	4	17185	17196	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
20	NC_018365	TTA	4	18174	18186	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_018365	AAT	4	20913	20923	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018365	TAA	6	21420	21437	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
23	NC_018365	ATG	4	22473	22485	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	40020183
24	NC_018365	ATT	4	23026	23037	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020183
25	NC_018365	ATT	4	25960	25970	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020183
26	NC_018365	TAA	4	33403	33413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_018365	AGG	4	33737	33748	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_018365	ATA	4	36485	36497	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020183
29	NC_018365	GTA	4	37345	37356	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40020183
30	NC_018365	TAT	5	37771	37785	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020183
31	NC_018365	TTA	4	39152	39163	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020183
32	NC_018365	GGT	4	39843	39854	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40020183
33	NC_018365	TGA	4	40831	40841	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40020183
34	NC_018365	TAT	5	42667	42681	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020183
35	NC_018365	ATA	4	43073	43084	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020183
36	NC_018365	TTA	4	43182	43192	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020183
37	NC_018365	ATA	4	43688	43700	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020183
38	NC_018365	TAA	4	46271	46282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020183
39	NC_018365	AAT	4	47348	47359	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018365	ATA	4	48295	48306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_018365	ACC	4	48609	48619	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
42	NC_018365	GAT	4	48969	48979	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018365	ATA	7	49190	49210	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_018365	GAA	4	50581	50592	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018365	TAA	4	52189	52199	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_018365	TAT	4	52219	52230	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_018365	ATT	4	52969	52980	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_018365	ATA	4	53128	53139	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020184
49	NC_018365	AAT	4	54029	54040	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020184
50	NC_018365	TAA	4	54257	54268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020184
51	NC_018365	TTA	4	55638	55649	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_018365	TAA	4	56356	56366	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020184
53	NC_018365	ACA	4	60980	60991	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_018365	ATA	5	61290	61305	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
55	NC_018365	ATT	4	61915	61926	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_018365	ATA	5	62135	62149	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_018365	TAT	5	63437	63450	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_018365	TAT	5	63847	63861	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_018365	ATT	4	64178	64188	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_018365	TAT	4	64279	64290	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_018365	TAA	4	64789	64800	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_018365	TAT	4	65945	65955	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018365	TAA	4	65999	66009	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_018365	TAA	8	72637	72660	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_018365	TAC	7	73124	73143	20	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
66	NC_018365	ATA	4	75101	75112	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_018365	TCT	4	75398	75409	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40020184
68	NC_018365	TAC	4	75826	75836	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	40020184
69	NC_018365	ATA	4	76142	76153	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020184
70	NC_018365	ATA	4	77632	77642	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020184
71	NC_018365	TAA	4	79483	79494	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020184
72	NC_018365	CAG	4	79890	79901	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
73	NC_018365	TAT	4	80223	80235	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_018365	TAA	4	80300	80312	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_018365	AAC	5	80514	80528	15	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
76	NC_018365	ACA	7	80553	80573	21	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
77	NC_018365	TAA	4	80655	80665	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_018365	CAA	4	82650	82661	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	40020184
79	NC_018365	TTA	4	84173	84184	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_018365	TTA	4	88023	88034	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_018365	ATA	5	89472	89485	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_018365	AAT	4	90513	90525	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020184
83	NC_018365	TAT	4	90722	90733	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020184
84	NC_018365	TTA	4	91876	91886	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020184
85	NC_018365	GTA	4	92346	92357	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_018365	TAA	6	92728	92744	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
87	NC_018365	AGA	4	93048	93058	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
88	NC_018365	TAA	4	94596	94607	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_018365	TTA	4	94932	94942	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020185
90	NC_018365	TAA	4	96561	96572	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_018365	CAA	5	96674	96687	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
92	NC_018365	ATA	5	97909	97923	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020185
93	NC_018365	TAT	4	98819	98830	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020185
94	NC_018365	ATT	4	99881	99893	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_018365	TAA	4	101123	101133	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_018365	ATT	4	101312	101322	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_018365	TAA	5	101707	101720	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
98	NC_018365	ATT	4	102448	102460	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_018365	ATT	4	102565	102576	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_018365	TAA	4	103257	103268	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_018365	AAT	4	103979	103990	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
102	NC_018365	ATA	4	104091	104102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_018365	ATA	4	104297	104308	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_018365	TAA	4	105953	105964	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_018365	ATA	4	106538	106549	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_018365	ATA	4	106598	106609	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_018365	ATA	5	108376	108393	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
108	NC_018365	ATA	5	109920	109934	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_018365	TAA	5	110839	110852	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_018365	ATA	5	110930	110943	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_018365	GGA	4	111705	111716	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_018365	TTA	4	112245	112257	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
113	NC_018365	TCC	4	113526	113536	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
114	NC_018365	ATT	4	114242	114252	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_018365	CAA	4	116799	116810	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	40020185
116	NC_018365	TAA	4	117616	117626	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020185
117	NC_018365	ATT	4	118061	118072	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020185
118	NC_018365	TAA	4	119182	119193	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020185
119	NC_018365	TAA	4	119703	119714	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020185

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Lentinula edodes mitochondrion