ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lentinula edodes mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018365	CAAA	3	639	650	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_018365	ACAAAA	4	678	701	24	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018365	TAAA	3	884	895	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020182
4	NC_018365	AT	6	1207	1217	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020182
5	NC_018365	ATA	4	1601	1611	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020182
6	NC_018365	AT	6	1747	1758	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020182
7	NC_018365	TAAA	4	1761	1776	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	40020182
8	NC_018365	TATT	3	2010	2021	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	40020182
9	NC_018365	TTAA	3	2494	2505	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020182
10	NC_018365	GGCT	3	2820	2831	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	40020182
11	NC_018365	TTA	4	3747	3761	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020182
12	NC_018365	TAT	6	4162	4180	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	40020182
13	NC_018365	GCTA	3	4203	4213	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	40020182
14	NC_018365	ATTTT	3	4321	4335	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	40020182
15	NC_018365	T	12	5195	5206	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	40020182
16	NC_018365	A	19	5597	5615	19	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	40020182
17	NC_018365	TATT	3	5637	5648	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020182
18	NC_018365	TAT	4	6254	6265	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
19	NC_018365	TAT	4	6330	6341	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
20	NC_018365	TTGT	3	6358	6369	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	40020182
21	NC_018365	AGG	4	7353	7363	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	40020182
22	NC_018365	AGGG	3	7859	7871	13	25 %	0 %	75 %	0 %	7 %	40020182
23	NC_018365	A	17	8312	8328	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	40020182
24	NC_018365	ATT	5	8814	8828	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020182
25	NC_018365	AAATT	3	9084	9097	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	40020182
26	NC_018365	TAT	4	9114	9124	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_018365	TATT	3	9131	9141	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_018365	TTTGT	3	10128	10142	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_018365	AAT	4	10472	10482	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_018365	GGTGG	3	10888	10902	15	0 %	20 %	80 %	0 %	6 %	Non-Coding
31	NC_018365	CCCA	3	11150	11162	13	25 %	0 %	0 %	75 %	7 %	Non-Coding
32	NC_018365	AGGG	4	11212	11227	16	25 %	0 %	75 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_018365	TAAAA	3	11297	11311	15	80 %	20 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018365	AAT	5	11646	11660	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020182
35	NC_018365	ATT	4	11762	11772	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020182
36	NC_018365	TTAT	3	12633	12644	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018365	AAAT	3	12665	12675	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_018365	GAG	4	13510	13521	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018365	TCT	9	13567	13593	27	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
40	NC_018365	TCC	4	13594	13605	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
41	NC_018365	TCCAGA	3	13626	13643	18	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
42	NC_018365	AAT	4	13954	13965	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_018365	TAAT	3	14405	14416	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_018365	TAATA	5	14584	14608	25	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018365	TCC	4	14826	14836	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
46	NC_018365	G	15	15134	15148	15	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
47	NC_018365	AAT	4	15248	15259	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_018365	TTA	4	15336	15348	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_018365	A	13	15682	15694	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_018365	TTAAC	4	16313	16331	19	40 %	40 %	0 %	20 %	10 %	Non-Coding
51	NC_018365	TTTTTC	3	16589	16606	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
52	NC_018365	TAT	4	17185	17196	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
53	NC_018365	TAAA	3	18068	18080	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_018365	TAAA	3	18092	18104	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_018365	TTA	4	18174	18186	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_018365	GTAGCA	7	18227	18268	42	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	9 %	Non-Coding
57	NC_018365	ATTTAA	3	19306	19323	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020183
58	NC_018365	TTCA	3	19919	19930	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	40020183
59	NC_018365	ATAATT	3	20101	20118	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018365	TA	7	20253	20266	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_018365	TATAT	3	20398	20412	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_018365	TTTA	3	20888	20899	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_018365	AAT	4	20913	20923	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_018365	TACTTA	4	20969	20992	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
65	NC_018365	TAA	6	21420	21437	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
66	NC_018365	AAAT	3	21536	21547	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020183
67	NC_018365	ATG	4	22473	22485	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	40020183
68	NC_018365	TAAA	3	22538	22549	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020183
69	NC_018365	TAAA	3	22567	22577	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020183
70	NC_018365	AATT	3	22706	22716	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020183
71	NC_018365	AGAAA	6	22934	22964	31	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	40020183
72	NC_018365	TATTAA	3	22992	23009	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020183
73	NC_018365	ATT	4	23026	23037	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020183
74	NC_018365	TAAT	4	23102	23118	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020183
75	NC_018365	TATAT	13	23280	23342	63	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	40020183
76	NC_018365	TGTT	3	23777	23788	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	40020183
77	NC_018365	ATTA	3	24019	24031	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_018365	TTTATT	9	25366	25418	53	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_018365	ATT	4	25960	25970	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020183
80	NC_018365	TA	7	26240	26252	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020183
81	NC_018365	TAAAA	3	27117	27130	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	40020183
82	NC_018365	GTAGC	3	29548	29562	15	20 %	20 %	40 %	20 %	6 %	Non-Coding
83	NC_018365	AAAT	3	29622	29632	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_018365	GAGG	3	31774	31785	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_018365	GAAG	3	31819	31829	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_018365	TATT	3	31996	32007	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018365	TAAA	3	32018	32029	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_018365	ATAATT	3	32733	32751	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
89	NC_018365	G	14	33114	33127	14	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018365	TAA	4	33403	33413	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
91	NC_018365	A	14	33412	33425	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_018365	C	30	33661	33690	30	0 %	0 %	0 %	100 %	3 %	Non-Coding
93	NC_018365	AGG	4	33737	33748	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_018365	ATATAA	3	34147	34164	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
95	NC_018365	AAATAA	3	34662	34679	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
96	NC_018365	TAAAAA	3	35106	35123	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
97	NC_018365	ATTAA	6	35236	35265	30	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_018365	ATAAAA	3	35304	35321	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
99	NC_018365	AGCC	3	35542	35553	12	25 %	0 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
100	NC_018365	G	16	35674	35689	16	0 %	0 %	100 %	0 %	6 %	Non-Coding
101	NC_018365	ATA	4	36485	36497	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020183
102	NC_018365	AAATTA	3	37116	37133	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	40020183
103	NC_018365	TAAAA	10	37120	37171	52	80 %	20 %	0 %	0 %	9 %	40020183
104	NC_018365	GTA	4	37345	37356	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40020183
105	NC_018365	AT	8	37589	37604	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	40020183
106	NC_018365	TACATA	4	37609	37632	24	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	40020183
107	NC_018365	TAT	5	37771	37785	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020183
108	NC_018365	TTACCC	3	38006	38023	18	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	5 %	40020183
109	NC_018365	TTA	4	39152	39163	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020183
110	NC_018365	GGT	4	39843	39854	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40020183
111	NC_018365	TGA	4	40831	40841	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40020183
112	NC_018365	TTTTA	3	41517	41531	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	40020183
113	NC_018365	TAT	5	42667	42681	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40020183
114	NC_018365	ATA	4	43073	43084	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020183
115	NC_018365	TTA	4	43182	43192	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020183
116	NC_018365	ATA	4	43688	43700	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020183
117	NC_018365	TTTTAC	3	43845	43862	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	40020183
118	NC_018365	AATT	3	44997	45008	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020183
119	NC_018365	AATT	3	45011	45021	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020183
120	NC_018365	TAA	4	46271	46282	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020183
121	NC_018365	TA	7	46808	46820	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020183
122	NC_018365	TATAAG	10	47124	47183	60	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_018365	AAT	4	47348	47359	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
124	NC_018365	ACGCT	3	47515	47528	14	20 %	20 %	20 %	40 %	7 %	Non-Coding
125	NC_018365	A	12	47605	47616	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_018365	TAAAAG	3	47618	47635	18	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
127	NC_018365	ATA	4	48295	48306	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_018365	ACC	4	48609	48619	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	Non-Coding
129	NC_018365	GAT	4	48969	48979	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_018365	ATA	7	49190	49210	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_018365	GGAGTA	3	49275	49293	19	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
132	NC_018365	CCTTT	3	49324	49338	15	0 %	60 %	0 %	40 %	6 %	Non-Coding
133	NC_018365	CCTTCC	3	49372	49390	19	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	10 %	Non-Coding
134	NC_018365	C	16	49434	49449	16	0 %	0 %	0 %	100 %	6 %	Non-Coding
135	NC_018365	TTAA	3	49843	49855	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_018365	A	13	49873	49885	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_018365	ATATTT	13	50019	50094	76	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
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139	NC_018365	TAAATA	3	50287	50303	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
140	NC_018365	AAAT	3	50337	50347	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_018365	GAA	4	50581	50592	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_018365	GATA	3	51509	51519	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
143	NC_018365	TAA	4	52189	52199	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_018365	TAT	4	52219	52230	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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146	NC_018365	T	12	52891	52902	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
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148	NC_018365	TTAA	3	52985	52996	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
149	NC_018365	ATA	4	53128	53139	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020184
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153	NC_018365	TAAAA	3	54228	54242	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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157	NC_018365	TAA	4	56356	56366	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020184
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164	NC_018365	ATATA	6	58498	58527	30	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
165	NC_018365	AATTA	7	58523	58556	34	60 %	40 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
166	NC_018365	A	17	60028	60044	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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168	NC_018365	ATAAAA	3	61051	61068	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
169	NC_018365	AAAT	3	61069	61080	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
170	NC_018365	TA	7	61081	61093	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
171	NC_018365	AGATT	3	61131	61145	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_018365	ATA	5	61290	61305	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
173	NC_018365	TCTA	3	61871	61881	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
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175	NC_018365	TATT	3	61968	61978	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
176	NC_018365	ATA	5	62135	62149	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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179	NC_018365	TAT	5	63847	63861	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
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254	NC_018365	ATGT	3	82536	82546	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
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259	NC_018365	TTAT	3	83800	83811	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
260	NC_018365	TTA	4	84173	84184	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
261	NC_018365	ATTTA	3	84452	84465	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
262	NC_018365	TTAAA	3	85502	85515	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
263	NC_018365	TAATTT	3	85636	85653	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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265	NC_018365	CCCT	3	86005	86016	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding
266	NC_018365	TACTCC	9	86050	86102	53	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
267	NC_018365	AAGG	3	86876	86886	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
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269	NC_018365	ATAAAA	3	87820	87837	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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372	NC_018365	GGATTA	5	121141	121176	36	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
373	NC_018365	CCTC	3	121361	121372	12	0 %	25 %	0 %	75 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lentinula edodes mitochondrion