ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Madrepora oculata mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018364	TGTT	3	545	555	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	40020182
2	NC_018364	TTTA	3	625	636	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020182
3	NC_018364	TTAA	5	723	742	20	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020182
4	NC_018364	CTTA	3	1095	1106	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	40020182
5	NC_018364	GTTT	3	1392	1402	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	40020182
6	NC_018364	TAT	4	1530	1541	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
7	NC_018364	GTTTT	3	1905	1919	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	40020182
8	NC_018364	T	12	2059	2070	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	40020182
9	NC_018364	ATTT	3	2336	2346	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020182
10	NC_018364	GTTTT	4	2498	2516	19	0 %	80 %	20 %	0 %	10 %	40020182
11	NC_018364	TTTAT	4	2861	2879	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	40020182
12	NC_018364	TTG	4	3156	3167	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40020182
13	NC_018364	GTTT	3	3170	3180	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	40020182
14	NC_018364	TTCT	3	3624	3634	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	40020182
15	NC_018364	T	15	4179	4193	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	40020182
16	NC_018364	TTTTA	3	4263	4276	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	40020182
17	NC_018364	T	12	4553	4564	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	40020182
18	NC_018364	ATTGTT	4	4938	4960	23	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	8 %	40020182
19	NC_018364	T	13	5089	5101	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	40020182
20	NC_018364	GGTTT	3	5392	5406	15	0 %	60 %	40 %	0 %	0 %	40020182
21	NC_018364	TGTT	3	5477	5487	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	40020182
22	NC_018364	T	13	5638	5650	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	40020182
23	NC_018364	T	13	6019	6031	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	40020182
24	NC_018364	T	12	6050	6061	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	40020182
25	NC_018364	TTTA	3	6350	6361	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020182
26	NC_018364	TTCT	3	6768	6778	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	40020182
27	NC_018364	T	12	7921	7932	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	40020182
28	NC_018364	ATT	4	8325	8336	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020182
29	NC_018364	GTT	4	8955	8966	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40020182
30	NC_018364	T	24	9361	9384	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	40020182
31	NC_018364	GTT	5	10070	10084	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	40020182
32	NC_018364	GTTTT	3	10358	10372	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	40020182
33	NC_018364	AAG	4	11470	11481	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40020182
34	NC_018364	T	12	11744	11755	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	40020182
35	NC_018364	ATTT	3	11846	11856	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020182
36	NC_018364	CTTT	3	12071	12082	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	40020181
37	NC_018364	ATAA	3	13869	13880	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_018364	A	16	13917	13932	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
39	NC_018364	AGCG	3	14086	14096	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	Non-Coding
40	NC_018364	ATTT	3	14247	14257	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_018364	T	14	14508	14521	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_018364	TAAA	3	14640	14651	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_018364	A	14	14977	14990	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Madrepora oculata mitochondrion