ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sphaerotheriidae sp. HYS-2012 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018361	TTCA	3	1671	1681	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	40020177
2	NC_018361	TTAA	3	2423	2433	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020177
3	NC_018361	AAT	4	3063	3074	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020177
4	NC_018361	CAT	4	4079	4090	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40020177
5	NC_018361	ATT	4	4867	4879	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020177
6	NC_018361	TAA	4	5539	5550	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020177
7	NC_018361	ATCCC	3	6105	6119	15	20 %	20 %	0 %	60 %	6 %	40020177
8	NC_018361	CAAT	4	6299	6313	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	40020177
9	NC_018361	AAAG	3	6713	6723	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	40020177
10	NC_018361	TAA	4	7400	7411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020177
11	NC_018361	TAAA	3	7538	7550	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	40020177
12	NC_018361	ATA	4	9136	9147	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020178
13	NC_018361	TAC	6	10168	10185	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	40020178
14	NC_018361	AATT	4	10867	10882	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	40020178
15	NC_018361	ATTA	3	11420	11431	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_018361	ATA	5	11432	11447	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_018361	TAA	4	11453	11464	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018361	TAA	4	11765	11776	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_018361	TAA	4	11909	11921	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_018361	ACTT	3	12135	12146	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_018361	AAC	4	12637	12647	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018361	ATTTCA	3	13044	13062	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
23	NC_018361	TAAT	3	13148	13160	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_018361	T	14	13199	13212	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_018361	GAA	4	13213	13223	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018361	ACTA	3	13355	13366	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
27	NC_018361	ATT	5	13825	13838	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020178
28	NC_018361	CATT	3	14219	14229	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	40020178
29	NC_018361	TCA	4	14491	14502	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40020178
30	NC_018361	ATTA	3	14685	14695	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020178

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Sphaerotheriidae sp. HYS-2012 mitochondrion