ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Madurella mycetomatis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018359	ATTAAA	3	244	261	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_018359	AT	6	1401	1412	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_018359	TATAAA	3	1514	1530	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
4	NC_018359	ATAA	3	1830	1841	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018359	AAAAT	4	1960	1978	19	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
6	NC_018359	ATATTT	3	2020	2037	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
7	NC_018359	T	12	2459	2470	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_018359	TAAA	3	3777	3788	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018359	T	12	3901	3912	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018359	TA	6	3915	3926	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018359	TTA	4	4085	4095	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_018359	TAT	4	4441	4451	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_018359	TTTA	3	4673	4685	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	40020173
14	NC_018359	TA	6	4687	4697	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020173
15	NC_018359	AAT	4	4790	4801	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020173
16	NC_018359	TTAT	3	4817	4827	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020173
17	NC_018359	TAT	4	5454	5465	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_018359	TAA	4	5468	5478	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018359	TA	6	5504	5514	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_018359	AT	9	5553	5569	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
21	NC_018359	ACTT	3	5663	5673	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_018359	AT	6	5692	5702	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_018359	TA	8	5716	5730	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_018359	ATA	4	6189	6199	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_018359	TGT	4	6213	6223	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018359	AT	8	6252	6266	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_018359	AAT	5	6918	6932	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_018359	TTTA	3	6975	6985	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_018359	TTA	5	8100	8113	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
30	NC_018359	ATA	6	8545	8561	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	40020173
31	NC_018359	AAGA	3	8620	8631	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	40020173
32	NC_018359	TAA	4	8822	8833	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020173
33	NC_018359	ATA	4	9436	9447	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020173
34	NC_018359	TAAT	3	10158	10168	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_018359	AT	12	10196	10218	23	50 %	50 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
36	NC_018359	CTTT	5	10832	10851	20	0 %	75 %	0 %	25 %	5 %	Non-Coding
37	NC_018359	AATT	3	10958	10969	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018359	TTTAAA	4	11066	11089	24	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018359	ATT	4	11245	11257	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_018359	TTA	4	11493	11503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_018359	CATG	3	11678	11689	12	25 %	25 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018359	A	13	11965	11977	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018359	A	12	12664	12675	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_018359	TA	6	13294	13304	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020173
45	NC_018359	TTA	4	13720	13730	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020173
46	NC_018359	ATA	4	13818	13830	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020173
47	NC_018359	TAT	4	14308	14320	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020173
48	NC_018359	TTTA	4	14444	14459	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	40020173
49	NC_018359	AT	6	15782	15792	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020173
50	NC_018359	ATTT	3	15848	15858	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020173
51	NC_018359	ATA	5	16091	16105	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020173
52	NC_018359	TAT	7	16106	16126	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_018359	TTTG	4	16146	16161	16	0 %	75 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_018359	GGCAG	3	16280	16294	15	20 %	0 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018359	AT	12	16372	16395	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
56	NC_018359	TAAT	3	16458	16468	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020173
57	NC_018359	ATT	4	17316	17328	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020173
58	NC_018359	ATA	5	17899	17913	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020173
59	NC_018359	ATT	4	18052	18062	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020173
60	NC_018359	AT	12	18598	18621	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_018359	TA	6	18763	18774	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_018359	TAAA	3	18777	18787	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018359	AAAAG	3	18828	18841	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_018359	AATGC	3	19098	19111	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
65	NC_018359	TAG	4	19122	19132	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_018359	TAATAC	4	19746	19770	25	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	8 %	Non-Coding
67	NC_018359	ATA	4	20045	20055	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_018359	CTAT	3	20348	20358	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	40020174
69	NC_018359	TAA	4	20786	20797	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020174
70	NC_018359	TTTA	3	20860	20871	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020174
71	NC_018359	AGTA	3	21692	21703	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	40020174
72	NC_018359	TA	6	22759	22770	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020174
73	NC_018359	TA	7	22802	22814	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020174
74	NC_018359	TTA	4	22825	22836	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020174
75	NC_018359	TAG	5	23099	23113	15	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	6 %	40020174
76	NC_018359	TAAAA	3	23519	23532	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	40020174
77	NC_018359	TTTA	3	23534	23545	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020174
78	NC_018359	TAAAA	3	23569	23582	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	40020174
79	NC_018359	TA	6	23909	23919	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020174
80	NC_018359	ATATT	3	24597	24610	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	40020174
81	NC_018359	AGCGAT	3	24691	24708	18	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
82	NC_018359	ATA	7	24725	24745	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
83	NC_018359	ATA	5	24827	24841	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_018359	TA	7	25636	25650	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
85	NC_018359	TAT	4	26294	26304	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_018359	TTTTTA	3	27708	27726	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	40020174
87	NC_018359	TTG	4	29667	29678	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_018359	TAT	4	29695	29706	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_018359	TA	18	29728	29760	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_018359	AAAT	3	29896	29907	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_018359	TAT	4	30311	30322	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020174
92	NC_018359	TTA	4	30458	30468	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020174
93	NC_018359	ATA	4	30737	30747	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020174
94	NC_018359	TAAA	3	31313	31323	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020174
95	NC_018359	TTA	4	32755	32766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020174
96	NC_018359	ATT	4	33078	33090	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020174
97	NC_018359	TTTA	3	34082	34092	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020174
98	NC_018359	GTTCAG	3	34339	34356	18	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	5 %	40020174
99	NC_018359	TA	6	34484	34494	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020174
100	NC_018359	TTTA	3	34814	34825	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_018359	TA	8	35029	35044	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_018359	TA	13	35828	35852	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
103	NC_018359	ATA	4	36109	36119	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020174
104	NC_018359	AT	6	37222	37232	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020175
105	NC_018359	AATT	3	38265	38276	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	40020175
106	NC_018359	TAT	4	38390	38400	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
107	NC_018359	ATA	4	38597	38609	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
108	NC_018359	AT	6	39095	39105	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020175
109	NC_018359	TATAT	3	39331	39344	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	40020175
110	NC_018359	TTA	4	39570	39582	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020175
111	NC_018359	ATCA	3	40317	40328	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018359	AT	6	40690	40700	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020175
113	NC_018359	AT	6	40763	40773	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020175
114	NC_018359	AAT	4	40815	40826	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020175
115	NC_018359	TAA	4	40883	40894	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020175
116	NC_018359	TAT	4	40940	40951	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020175
117	NC_018359	TAT	4	41072	41084	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020175
118	NC_018359	TTTA	3	41901	41911	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020175
119	NC_018359	TTAA	3	42020	42031	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_018359	GTCC	3	42394	42405	12	0 %	25 %	25 %	50 %	8 %	Non-Coding
121	NC_018359	TTAA	3	42478	42488	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_018359	CTT	4	43450	43462	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	40020175
123	NC_018359	ATT	7	43589	43610	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_018359	AAT	4	43664	43674	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_018359	AATC	3	43879	43890	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
126	NC_018359	ATA	4	44120	44134	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020175
127	NC_018359	AGC	4	45037	45048	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
128	NC_018359	AAG	4	45433	45443	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding

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