ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia denudata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018357	CAG	4	1064	1075	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40025656
2	NC_018357	AGA	4	2178	2189	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40025656
3	NC_018357	CAT	4	6605	6616	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
4	NC_018357	TAT	5	14205	14218	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_018357	ATT	5	14809	14824	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_018357	TGT	4	17864	17874	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	40025657
7	NC_018357	GTT	4	24768	24779	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40025657
8	NC_018357	CAG	4	29396	29407	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_018357	GTA	4	34995	35005	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018357	TTG	4	37293	37303	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	40025658
11	NC_018357	ATG	4	41288	41298	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	40025658
12	NC_018357	GCA	4	43186	43197	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40025658
13	NC_018357	TAA	4	44791	44803	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_018357	ATT	4	47269	47280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_018357	AGT	4	48193	48204	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40025659
16	NC_018357	TAT	4	49116	49127	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_018357	ATA	5	57880	57893	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40025659
18	NC_018357	TTA	4	63211	63221	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_018357	CTT	4	67565	67577	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
20	NC_018357	AGT	4	69161	69173	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
21	NC_018357	TTA	4	69603	69614	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_018357	TCT	4	71537	71548	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_018357	AGA	4	72356	72366	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_018357	CTG	4	73960	73971	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	40025661
25	NC_018357	TAT	5	74696	74711	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	40025661
26	NC_018357	TCT	4	74738	74749	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40025661
27	NC_018357	ATA	4	82821	82832	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40025661
28	NC_018357	GGA	4	83926	83938	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_018357	CTT	4	88212	88223	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40025662
30	NC_018357	GAT	4	90043	90053	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_018357	GAT	4	93071	93082	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40025663
32	NC_018357	TGA	4	94804	94815	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	40025663
33	NC_018357	CTT	4	107382	107393	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
34	NC_018357	TAT	4	115475	115487	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40025663
35	NC_018357	TTA	4	116991	117002	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_018357	ATT	4	117650	117660	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_018357	TTC	4	117854	117866	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
38	NC_018357	TGT	4	118458	118469	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_018357	TAT	4	119470	119480	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_018357	CTT	4	120267	120277	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	40025663
41	NC_018357	ATA	4	123489	123500	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_018357	AAT	4	128857	128868	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018357	TTA	4	145182	145193	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_018357	ATC	4	155073	155084	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40025664
45	NC_018357	ATC	4	158102	158112	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Magnolia denudata chloroplast