ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Cucujus clavipes mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018350	ATT	4	401	411	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020163
2	NC_018350	TAT	4	415	426	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020163
3	NC_018350	ATT	4	653	664	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	40020163
4	NC_018350	ATTT	3	836	846	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020163
5	NC_018350	TACAT	3	1039	1052	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	40020163
6	NC_018350	ATT	4	1142	1152	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020163
7	NC_018350	CT	6	2863	2873	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40020162
8	NC_018350	ATT	4	3120	3131	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020162
9	NC_018350	ATTA	6	4542	4564	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020162
10	NC_018350	TTTATT	3	5541	5559	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	40020162
11	NC_018350	ATA	4	6205	6216	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018350	AATA	3	6260	6270	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020162
13	NC_018350	ATT	4	6292	6303	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020162
14	NC_018350	AGA	4	6489	6499	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	40020162
15	NC_018350	ATT	4	6586	6597	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020162
16	NC_018350	AATA	3	6819	6830	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020162
17	NC_018350	AAG	4	7367	7378	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40020162
18	NC_018350	TAA	4	7661	7673	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020162
19	NC_018350	TAA	4	7701	7711	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020162
20	NC_018350	AATAAA	3	7936	7954	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	40020162
21	NC_018350	AAAT	3	8043	8054	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020162
22	NC_018350	AAAT	3	8067	8078	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020162
23	NC_018350	TAA	4	8095	8109	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	40020162
24	NC_018350	ATATTA	3	8214	8231	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	40020162
25	NC_018350	ACA	4	8317	8328	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	40020162
26	NC_018350	ATAA	3	8769	8780	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020162
27	NC_018350	TAAA	3	8851	8861	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020162
28	NC_018350	TAAA	4	8883	8899	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	40020162
29	NC_018350	A	14	9344	9357	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	40020162
30	NC_018350	AT	6	9510	9520	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020162
31	NC_018350	TTTATA	3	9810	9827	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	40020162
32	NC_018350	TCTA	3	9959	9970	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	40020162
33	NC_018350	TAA	4	10180	10191	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020162
34	NC_018350	TCT	4	10858	10869	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40020162
35	NC_018350	TAT	4	11257	11268	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020162
36	NC_018350	ATA	4	11532	11543	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020163
37	NC_018350	AAT	4	11645	11656	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020163
38	NC_018350	ATAAA	3	12102	12115	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	40020163
39	NC_018350	TAAA	3	12850	12861	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_018350	ATTAAA	4	13245	13268	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
41	NC_018350	TAA	4	13441	13453	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_018350	ATA	5	13693	13706	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
43	NC_018350	TAAA	3	13961	13976	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_018350	AAAT	3	14155	14166	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018350	TTTAA	3	14348	14362	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018350	TA	7	15078	15090	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_018350	TA	6	15135	15147	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
48	NC_018350	TA	11	15148	15170	23	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
49	NC_018350	AT	11	15188	15208	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_018350	TA	7	15234	15247	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_018350	TA	8	15408	15423	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
52	NC_018350	AT	6	15460	15472	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_018350	TA	8	15483	15498	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
54	NC_018350	ATTT	3	15619	15631	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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