ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Tropisternus sp. BYU-CO166 mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018349	GTAT	3	654	664	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	40020160
2	NC_018349	TTTAAA	3	1292	1310	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
3	NC_018349	CTT	4	1971	1982	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	40020160
4	NC_018349	TAT	4	2791	2801	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020160
5	NC_018349	TCTT	3	4185	4196	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	40020161
6	NC_018349	CATA	3	4331	4343	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	40020161
7	NC_018349	ACT	4	4549	4560	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40020161
8	NC_018349	CAAT	3	4584	4595	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	40020161
9	NC_018349	TA	6	5439	5449	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_018349	TTTATA	3	6109	6126	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_018349	ATT	4	6309	6320	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020161
12	NC_018349	TAAA	3	6618	6629	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020161
13	NC_018349	AAAT	6	6818	6839	22	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020161
14	NC_018349	TAAA	3	7040	7050	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020161
15	NC_018349	TTA	4	7115	7126	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020161
16	NC_018349	AACA	3	7276	7287	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	40020161
17	NC_018349	TAA	4	7655	7667	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020161
18	NC_018349	CAAT	3	7873	7883	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	40020161
19	NC_018349	AGA	4	8125	8136	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	40020161
20	NC_018349	ATC	4	8331	8342	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	40020161
21	NC_018349	TAA	5	8616	8630	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020161
22	NC_018349	TAAA	3	9277	9287	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020161
23	NC_018349	AAAT	4	9505	9520	16	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	40020161
24	NC_018349	TA	6	9606	9616	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020161
25	NC_018349	TAA	4	9794	9805	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020161
26	NC_018349	AAT	4	10047	10058	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020161
27	NC_018349	TAAT	3	10278	10289	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020161
28	NC_018349	TTCC	3	10837	10847	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	40020161
29	NC_018349	CCAT	3	10945	10957	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	40020161
30	NC_018349	AAAT	3	11211	11222	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020161
31	NC_018349	TAT	4	11731	11742	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020161
32	NC_018349	TAAAT	3	12142	12157	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	40020161
33	NC_018349	CAAA	3	12185	12196	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	40020161
34	NC_018349	AAAT	3	12224	12234	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020161
35	NC_018349	TAAA	3	12828	12838	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
36	NC_018349	TTAA	3	12924	12935	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_018349	AAAT	3	13353	13363	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_018349	ATA	4	14274	14286	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
39	NC_018349	A	12	14721	14732	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018349	T	16	15452	15467	16	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018349	TAT	4	15634	15646	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_018349	TA	6	15753	15763	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018349	TA	8	15835	15850	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_018349	A	12	16091	16102	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018349	ACAA	3	16165	16175	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
46	NC_018349	AATA	3	16224	16235	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_018349	T	15	16300	16314	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Tropisternus sp. BYU-CO166 mitochondrion