ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Drosophila pseudoobscura mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018348	AT	9	161	178	18	50 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_018348	ATA	4	400	411	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40020159
3	NC_018348	ATA	4	1089	1100	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40020159
4	NC_018348	TAA	4	1196	1206	11	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	40020159
5	NC_018348	TAT	6	2042	2058	17	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	40020159
6	NC_018348	ATTC	4	2642	2657	16	25 %	50 %	25 %	6 %	40020159
7	NC_018348	TTAA	3	2997	3008	12	50 %	50 %	0 %	8 %	40020159
8	NC_018348	ATT	4	3327	3337	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	40020159
9	NC_018348	ATT	4	3731	3741	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	40020159
10	NC_018348	TAA	4	3849	3860	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_018348	ATT	4	4024	4036	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	40020159
12	NC_018348	ATT	4	5823	5834	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40020159
13	NC_018348	ATT	4	5877	5887	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	40020159
14	NC_018348	ATT	4	5925	5936	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40020159
15	NC_018348	CTTT	3	6224	6234	11	0 %	75 %	25 %	9 %	Non-Coding
16	NC_018348	AATA	3	6408	6419	12	75 %	25 %	0 %	0 %	40020159
17	NC_018348	TAT	4	6480	6492	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	40020159
18	NC_018348	AATT	3	6814	6825	12	50 %	50 %	0 %	8 %	40020159
19	NC_018348	A	13	6987	6999	13	100 %	0 %	0 %	7 %	40020159
20	NC_018348	TTAA	3	7239	7250	12	50 %	50 %	0 %	8 %	40020159
21	NC_018348	TTA	4	7284	7295	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40020159
22	NC_018348	ATA	6	7389	7406	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	40020159
23	NC_018348	ATT	4	7592	7603	12	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	40020159
24	NC_018348	AAAT	3	7628	7638	11	75 %	25 %	0 %	9 %	40020159
25	NC_018348	TAT	4	7837	7849	13	33.33 %	66.67 %	0 %	7 %	40020159
26	NC_018348	AATT	3	8826	8837	12	50 %	50 %	0 %	8 %	40020160
27	NC_018348	AAAT	3	8999	9011	13	75 %	25 %	0 %	7 %	40020160
28	NC_018348	AAAT	3	9118	9128	11	75 %	25 %	0 %	9 %	40020160
29	NC_018348	AAAAT	3	9207	9220	14	80 %	20 %	0 %	7 %	40020160
30	NC_018348	TAA	6	9253	9270	18	66.67 %	33.33 %	0 %	5 %	40020160
31	NC_018348	TAA	4	9280	9291	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40020160
32	NC_018348	TAA	4	9331	9342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	40020160
33	NC_018348	TAAA	5	9693	9713	21	75 %	25 %	0 %	9 %	40020160
34	NC_018348	AAAAT	3	9796	9809	14	80 %	20 %	0 %	7 %	40020160
35	NC_018348	ATTTT	4	10248	10266	19	20 %	80 %	0 %	5 %	40020160
36	NC_018348	TAAT	3	10435	10447	13	50 %	50 %	0 %	7 %	40020160
37	NC_018348	ATT	4	10860	10870	11	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	40020160
38	NC_018348	ATTT	3	11095	11105	11	25 %	75 %	0 %	9 %	40020160
39	NC_018348	TAAT	3	11640	11651	12	50 %	50 %	0 %	8 %	40020160
40	NC_018348	AAAT	3	11898	11908	11	75 %	25 %	0 %	9 %	40020160
41	NC_018348	TAA	4	12623	12635	13	66.67 %	33.33 %	0 %	7 %	40020160
42	NC_018348	TAAA	3	13207	13217	11	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_018348	AT	6	13843	13854	12	50 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_018348	AAAT	3	14044	14055	12	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_018348	TAT	5	14388	14402	15	33.33 %	66.67 %	0 %	6 %	Non-Coding
46	NC_018348	ATATTT	3	14551	14568	18	33.33 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Drosophila pseudoobscura mitochondrion