ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Aporia crataegi mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018346	TAA	4	472	483	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020156
2	NC_018346	TAT	4	617	628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020156
3	NC_018346	TTA	4	685	696	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020156
4	NC_018346	AATT	3	776	786	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020156
5	NC_018346	ATTA	3	806	816	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020156
6	NC_018346	CTTT	3	965	976	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	40020156
7	NC_018346	ATT	4	1017	1029	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020156
8	NC_018346	AT	7	1045	1057	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020156
9	NC_018346	TTA	4	1084	1094	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020156
10	NC_018346	TAAAAT	3	1157	1174	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	40020156
11	NC_018346	TTAA	3	1185	1195	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020156
12	NC_018346	TAT	4	1432	1443	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020156
13	NC_018346	TTA	4	2012	2023	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020156
14	NC_018346	GAAA	3	2223	2234	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	40020156
15	NC_018346	ATT	4	2652	2663	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020156
16	NC_018346	ATA	5	2834	2848	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	40020156
17	NC_018346	AATT	3	3704	3714	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020156
18	NC_018346	T	18	3895	3912	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	40020156
19	NC_018346	TTTTAA	3	3951	3968	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	40020156
20	NC_018346	AATT	3	3996	4006	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020156
21	NC_018346	ATTT	3	4349	4361	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	40020156
22	NC_018346	ATT	5	4833	4846	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020156
23	NC_018346	T	15	4963	4977	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	40020156
24	NC_018346	TAA	4	5143	5155	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020156
25	NC_018346	TAT	4	5830	5841	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020157
26	NC_018346	ATAA	3	6514	6525	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020157
27	NC_018346	TAT	4	6658	6669	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020157
28	NC_018346	ATT	4	6755	6766	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020157
29	NC_018346	AAAT	3	6897	6908	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020157
30	NC_018346	TTA	4	7176	7187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020157
31	NC_018346	TAA	4	7285	7296	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020157
32	NC_018346	ATA	4	7749	7760	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020157
33	NC_018346	AAAT	3	7761	7771	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020157
34	NC_018346	AAAT	3	7932	7943	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	40020157
35	NC_018346	AT	7	7983	7996	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020157
36	NC_018346	ATT	4	8026	8037	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_018346	TTTAA	4	8085	8103	19	40 %	60 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
38	NC_018346	ATA	4	8166	8178	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020157
39	NC_018346	TA	7	8922	8936	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	40020157
40	NC_018346	ATAAAA	3	8991	9009	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	40020157
41	NC_018346	AAAAT	3	9096	9109	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	40020157
42	NC_018346	TATAA	3	9136	9149	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	40020157
43	NC_018346	ATA	4	9181	9192	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020157
44	NC_018346	TTAA	3	9249	9261	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020157
45	NC_018346	AT	7	9553	9565	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020157
46	NC_018346	TTA	4	9569	9580	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020157
47	NC_018346	TAAA	3	9594	9604	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020157
48	NC_018346	ATT	5	9823	9837	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_018346	ATA	4	10181	10192	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020157
50	NC_018346	T	14	10649	10662	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	40020157
51	NC_018346	TAA	4	10750	10761	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020157
52	NC_018346	ATTT	3	10943	10953	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020157
53	NC_018346	TAT	4	11081	11094	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	40020157
54	NC_018346	TAAT	4	11519	11534	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	40020157
55	NC_018346	AAATA	3	11800	11814	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	40020157
56	NC_018346	TTAA	3	12038	12049	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020157
57	NC_018346	A	15	12209	12223	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	40020157
58	NC_018346	TAAAT	4	12228	12247	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	40020157
59	NC_018346	TAA	4	12248	12258	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020157
60	NC_018346	AAT	4	12308	12321	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020157
61	NC_018346	AAT	4	12495	12506	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	40020157
62	NC_018346	TAT	4	13329	13339	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_018346	TTA	4	13347	13358	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_018346	TAA	4	13485	13496	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_018346	TAA	4	13550	13562	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_018346	ATTAA	5	13573	13598	26	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_018346	TATT	6	13913	13936	24	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_018346	TTTTAA	3	14242	14260	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_018346	TAAAA	3	14707	14721	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_018346	TAAAT	4	14742	14762	21	60 %	40 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_018346	TTTA	3	14780	14791	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_018346	T	19	14811	14829	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_018346	CTTT	3	14869	14880	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
74	NC_018346	TA	12	14978	14999	22	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_018346	AT	17	15052	15084	33	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
76	NC_018346	TA	6	15119	15129	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Aporia crataegi mitochondrion