ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Celleporella hyalina mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_018344	TATT	3	52	62	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020155
2	NC_018344	TAAT	3	233	244	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020155
3	NC_018344	TGTT	3	1391	1402	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	40020155
4	NC_018344	TATT	3	1951	1962	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020155
5	NC_018344	T	15	2615	2629	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	40020155
6	NC_018344	TTTA	3	3564	3575	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	40020156
7	NC_018344	TG	7	4121	4133	13	0 %	50 %	50 %	0 %	7 %	40020156
8	NC_018344	T	14	4301	4314	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_018344	AT	7	4322	4334	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_018344	ATT	4	4359	4369	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_018344	TA	6	4399	4410	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_018344	AAT	4	4419	4430	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_018344	AT	6	4549	4559	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_018344	GA	6	4913	4924	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_018344	CA	6	4933	4943	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
16	NC_018344	AGA	4	4960	4970	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_018344	TCTG	3	5125	5135	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
18	NC_018344	TTTTG	3	5318	5332	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_018344	TAT	5	5450	5465	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_018344	TAT	4	6799	6809	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_018344	T	13	7051	7063	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_018344	A	12	7540	7551	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018344	TACTAA	3	7871	7887	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
24	NC_018344	TAA	4	8146	8157	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_018344	TAA	4	8205	8215	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_018344	AGCT	3	8366	8376	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_018344	A	12	8476	8487	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018344	T	13	8670	8682	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_018344	A	14	9839	9852	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	40020156
30	NC_018344	A	13	10248	10260	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	40020156
31	NC_018344	TA	6	11446	11457	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	40020155
32	NC_018344	ATT	4	11617	11628	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020155
33	NC_018344	TAAA	3	11931	11941	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	40020155
34	NC_018344	A	13	12135	12147	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	40020155
35	NC_018344	A	14	12769	12782	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	40020155
36	NC_018344	GAAAA	3	12806	12819	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	40020155
37	NC_018344	TA	7	13178	13190	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	40020155
38	NC_018344	A	12	13381	13392	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	40020155
39	NC_018344	ATT	4	13659	13670	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020155
40	NC_018344	TTA	4	14257	14267	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	40020155
41	NC_018344	AACA	3	14271	14282	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	40020155
42	NC_018344	T	23	14579	14601	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	40020155
43	NC_018344	TAA	5	14714	14727	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020155
44	NC_018344	ATA	4	14823	14835	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	40020155
45	NC_018344	ATT	4	14835	14846	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	40020155
46	NC_018344	GAAA	3	15031	15041	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	40020155
47	NC_018344	ATA	4	15064	15074	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	40020155
48	NC_018344	A	17	15209	15225	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	40020155
49	NC_018344	AAAAT	3	15560	15574	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	40020155
50	NC_018344	AT	6	15609	15619	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	40020155
51	NC_018344	TTTA	3	16031	16041	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	40020155
52	NC_018344	TTCT	5	16650	16670	21	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
53	NC_018344	CTA	4	16753	16764	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
54	NC_018344	TAT	5	17158	17172	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Celleporella hyalina mitochondrion